Efficient de novo assembly of single-cell bacterial genomes from short-read data sets.

Chitsaz, Hamidreza; Yee-Greenbaum, Joyclyn L; Tesler, Glenn; Lombardo, Mary-Jane; Dupont, Christopher L; Badger, Jonathan H; Novotny, Mark; Rusch, Douglas B; Fraser, Louise J; Gormley, Niall A; Schulz-Trieglaff, Ole; Smith, Geoffrey P; Evers, Dirk J; Pevzner, Pavel A; Lasken, Roger S

Chitsaz, Hamidreza; Yee-Greenbaum, Joyclyn L; Tesler, Glenn; Lombardo, Mary-Jane; Dupont, Christopher L; Badger, Jonathan H; Novotny, Mark; Rusch, Douglas B; Fraser, Louise J; Gormley, Niall A; Schulz-Trieglaff, Ole; Smith, Geoffrey P; Evers, Dirk J; Pevzner, Pavel A; Lasken, Roger S.

Afiliação

Chitsaz H; Department of Computer Science, University of California, La Jolla, CA, USA.

Nat Biotechnol ; 29(10): 915-21, 2011 Sep 18.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-21926975

Assuntos

Bactérias/citologia; Bactérias/genética; Bases de Dados de Ácidos Nucleicos; Genoma Bacteriano/genética; Análise de Sequência de DNA/métodos; Análise de Célula Única/métodos; Algoritmos; Sequência de Bases; Mapeamento de Sequências Contíguas; Deltaproteobacteria/citologia; Deltaproteobacteria/genética; Escherichia coli/citologia; Escherichia coli/genética; Funções Verossimilhança; Staphylococcus aureus/citologia; Staphylococcus aureus/genética

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Texto completo: 1 Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Bactérias / Genoma Bacteriano / Análise de Sequência de DNA / Bases de Dados de Ácidos Nucleicos / Análise de Célula Única Idioma: En Revista: Nat Biotechnol Assunto da revista: BIOTECNOLOGIA Ano de publicação: 2011 Tipo de documento: Article País de afiliação: Estados Unidos

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