Bioinformatics exploration of PAK1 (P21-activated kinase-1) revealed potential network gene elements in breast invasive carcinoma.

Yellapu, Nanda Kumar; Pulaganti, Madhusudana; Pakala, Suresh Babu

Yellapu, Nanda Kumar; Pulaganti, Madhusudana; Pakala, Suresh Babu.

Afiliação

Yellapu NK; a Biomedical Informatics Centre , Vector Control Research Centre (VCRC)-ICMR , Pondicherry 605006 , India.
Pulaganti M; b Multi-Disciplinary Research Unit , Sri Venkateswara Medical College , Tirupati 517501 , India.
Pakala SB; c Biology Division , Indian Institute of Science Education and Research (IISER) Tirupati , Tirupati 517507 , India.

J Biomol Struct Dyn ; 35(10): 2269-2279, 2017 Aug.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-27456030

Assuntos

Neoplasias da Mama/genética; Carcinoma Ductal de Mama/genética; Regulação Neoplásica da Expressão Gênica; Fator de Transcrição STAT3/química; Quinases Ativadas por p21/química; Proteína rhoA de Ligação ao GTP/química; Sítios de Ligação; Neoplasias da Mama/metabolismo; Neoplasias da Mama/patologia; Carcinoma Ductal de Mama/metabolismo; Carcinoma Ductal de Mama/patologia; Biologia Computacional/métodos; Cristalografia por Raios X; Bases de Dados Genéticas; Feminino; Redes Reguladoras de Genes; Humanos; Ligação de Hidrogênio; Simulação de Acoplamento Molecular; Ligação Proteica; Conformação Proteica em alfa-Hélice; Conformação Proteica em Folha beta; Domínios e Motivos de Interação entre Proteínas; Mapeamento de Interação de Proteínas; Fator de Transcrição STAT3/genética; Fator de Transcrição STAT3/metabolismo; Transdução de Sinais; Quinases Ativadas por p21/genética; Quinases Ativadas por p21/metabolismo; Proteína rhoA de Ligação ao GTP/genética; Proteína rhoA de Ligação ao GTP/metabolismo

Palavras-chave

GO enrichment; KEGG pathway; PAK1; breast cancer; interactome; molecular modelling

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Texto completo: 1 Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Neoplasias da Mama / Regulação Neoplásica da Expressão Gênica / Carcinoma Ductal de Mama / Proteína rhoA de Ligação ao GTP / Fator de Transcrição STAT3 / Quinases Ativadas por p21 Tipo de estudo: Prognostic_studies Limite: Female / Humans Idioma: En Revista: J Biomol Struct Dyn Ano de publicação: 2017 Tipo de documento: Article País de afiliação: Índia

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