String kernels for protein sequence comparisons: improved fold recognition.

Nojoomi, Saghi; Koehl, Patrice

Nojoomi, Saghi; Koehl, Patrice.

Afiliação

Nojoomi S; Biotechnology program, University of California, Davis, 1, Shields Avenue, Davis, CA, 95616, USA.
Koehl P; Department of Computer Science and Genome Center, 1, Shields Avenue, Davis, CA, 95616, USA. pakoehl@ucdavis.edu.

BMC Bioinformatics ; 18(1): 137, 2017 Feb 28.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-28245816

Assuntos

Análise de Sequência de Proteína/métodos; Homologia de Sequência de Aminoácidos; Algoritmos; RNA Polimerases Dirigidas por DNA/química; RNA Polimerases Dirigidas por DNA/classificação; Filogenia; Dobramento de Proteína; Proteínas/química; Alinhamento de Sequência

Palavras-chave

Alignment free methods; Kernel; Protein sequence

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Texto completo: 1 Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Homologia de Sequência de Aminoácidos / Análise de Sequência de Proteína Tipo de estudo: Prognostic_studies Idioma: En Revista: BMC Bioinformatics Assunto da revista: INFORMATICA MEDICA Ano de publicação: 2017 Tipo de documento: Article País de afiliação: Estados Unidos

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