Whole genome sequencing reveals high clonal diversity of <i>Escherichia coli</i> isolated from patients in a tertiary care hospital in Moshi, Tanzania.

Sonda, Tolbert; Kumburu, Happiness; van Zwetselaar, Marco; Alifrangis, Michael; Mmbaga, Blandina T; Aarestrup, Frank M; Kibiki, Gibson; Lund, Ole

Whole genome sequencing reveals high clonal diversity of Escherichia coli isolated from patients in a tertiary care hospital in Moshi, Tanzania.

Sonda, Tolbert; Kumburu, Happiness; van Zwetselaar, Marco; Alifrangis, Michael; Mmbaga, Blandina T; Aarestrup, Frank M; Kibiki, Gibson; Lund, Ole.

Afiliação

Sonda T; 1Kilimanjaro Clinical Research Institute, Kilimanjaro Christian Medical Centre, Moshi, Tanzania.
Kumburu H; 2Kilimanjaro Christian Medical University College, Moshi, Tanzania.
van Zwetselaar M; 1Kilimanjaro Clinical Research Institute, Kilimanjaro Christian Medical Centre, Moshi, Tanzania.
Alifrangis M; 2Kilimanjaro Christian Medical University College, Moshi, Tanzania.
Mmbaga BT; 1Kilimanjaro Clinical Research Institute, Kilimanjaro Christian Medical Centre, Moshi, Tanzania.
Aarestrup FM; Centre for Medical Parasitology, Department of Immunology and Microbiology, University of Copenhagen and Department of Infectious Diseases, Copenhagen University Hospital, Copenhagen, Denmark.
Kibiki G; 1Kilimanjaro Clinical Research Institute, Kilimanjaro Christian Medical Centre, Moshi, Tanzania.
Lund O; 2Kilimanjaro Christian Medical University College, Moshi, Tanzania.

Antimicrob Resist Infect Control ; 7: 72, 2018.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-29977533

Assuntos

Antibacterianos/farmacologia; Farmacorresistência Bacteriana Múltipla/genética; Infecções por Escherichia coli/epidemiologia; Escherichia coli/efeitos dos fármacos; Escherichia coli/isolamento & purificação; Hospitais/estatística & dados numéricos; Centros de Atenção Terciária/estatística & dados numéricos; Resistência beta-Lactâmica/genética; Combinação Amoxicilina e Clavulanato de Potássio/farmacologia; Estudos Transversais; Escherichia coli/classificação; Escherichia coli/genética; Genoma Bacteriano/genética; Humanos; Testes de Sensibilidade Microbiana; Tipagem de Sequências Multilocus; Filogenia; Tanzânia/epidemiologia; Combinação Trimetoprima e Sulfametoxazol/farmacologia; Fatores de Virulência; Sequenciamento Completo do Genoma; beta-Lactamases/genética

Palavras-chave

And virulence; E. coli; Multi-locus sequence typing; Serotyping; Tanzania; Whole genome sequencing

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Texto completo: 1 Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Resistência beta-Lactâmica / Farmacorresistência Bacteriana Múltipla / Escherichia coli / Infecções por Escherichia coli / Centros de Atenção Terciária / Hospitais / Antibacterianos Tipo de estudo: Observational_studies / Prevalence_studies / Prognostic_studies / Risk_factors_studies Limite: Humans País/Região como assunto: Africa Idioma: En Revista: Antimicrob Resist Infect Control Ano de publicação: 2018 Tipo de documento: Article País de afiliação: Tanzânia

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