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Genome Res ; 28(4): 432-447, 2018 04.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-29567676

RESUMO

The cancer-risk-associated rs6983267 single nucleotide polymorphism (SNP) and the accompanying long noncoding RNA CCAT2 in the highly amplified 8q24.21 region have been implicated in cancer predisposition, although causality has not been established. Here, using allele-specific CCAT2 transgenic mice, we demonstrate that CCAT2 overexpression leads to spontaneous myeloid malignancies. We further identified that CCAT2 is overexpressed in bone marrow and peripheral blood of myelodysplastic/myeloproliferative neoplasms (MDS/MPN) patients. CCAT2 induces global deregulation of gene expression by down-regulating EZH2 in vitro and in vivo in an allele-specific manner. We also identified a novel non-APOBEC, non-ADAR, RNA editing at the SNP locus in MDS/MPN patients and CCAT2-transgenic mice. The RNA transcribed from the SNP locus in malignant hematopoietic cells have different allelic composition from the corresponding genomic DNA, a phenomenon rarely observed in normal cells. Our findings provide fundamental insights into the functional role of rs6983267 SNP and CCAT2 in myeloid malignancies.


Assuntos
Proliferação de Células/genética , Doenças Mieloproliferativas-Mielodisplásicas/genética , RNA Longo não Codificante/genética , Adulto , Idoso , Idoso de 80 Anos ou mais , Animais , Linhagem Celular Tumoral , Feminino , Regulação Neoplásica da Expressão Gênica , Humanos , Masculino , Camundongos , Camundongos Transgênicos , Pessoa de Meia-Idade , Doenças Mieloproliferativas-Mielodisplásicas/patologia , Polimorfismo de Nucleotídeo Único/genética , Edição de RNA/genética
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