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1.
FEBS J ; 278(10): 1745-56, 2011 May.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-21418143

RESUMO

Genetic selection has been used to isolate second-site suppressors of a defective cold-sensitive initiation factor I (IF1) R69L mutant of Escherichia coli. The suppressor mutants specifically map to a single rRNA operon on a plasmid in a strain with all chromosomal rRNA operons deleted. Here, we describe a set of suppressor mutations that are located in the processing stem of precursor 23S rRNA. These mutations interfere with processing of the 23S rRNA termini. A lesion of RNase III also suppresses the cold sensitivity. Our results suggest that the mutant IF1 strain is perturbed at the level of ribosomal subunit association, and the suppressor mutations partially compensate for this defect by disrupting rRNA maturation. These results support the notion that IF1 is an RNA chaperone and that translation initiation is coupled to ribosomal maturation.


Assuntos
Fator de Iniciação 1 em Procariotos/genética , RNA Ribossômico 23S/genética , Sequência de Bases , Temperatura Baixa , Escherichia coli/genética , Escherichia coli/crescimento & desenvolvimento , Dados de Sequência Molecular , Mutação , Ribonuclease III/genética , Supressão Genética
2.
J Bacteriol ; 191(5): 1604-9, 2009 Mar.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-19103926

RESUMO

In Escherichia coli, release factor 1 (RF1) is one of two RFs that mediate termination; it specifically recognizes UAA and UAG stop codons. A mutant allele, prfA1, coding for an RF1 that causes temperature-sensitive (Ts) growth at 42 degrees C, was used to select for temperature-resistant (Ts(+)) suppressors. This study describes one such suppressor that is the result of an IS10 insertion into the cysB gene, giving a Cys(-) phenotype. CysB is a transcription factor regulating the cys regulon, mainly as an activator, which explains the Cys(-) phenotype. We have found that suppression is a consequence of the lost ability to donate sulfur to enzymes involved in the synthesis of thiolated nucleosides. From genetic analyses we conclude that it is the lack of the 5-methylaminomethyl-2-thiouridine (mnm(5)s(2)U) modification of the wobble base of tRNA(Glu), tRNA(Lys), and/or tRNA(Gln) that causes the suppressor phenotype.


Assuntos
Proteínas de Bactérias/genética , Proteínas de Escherichia coli/genética , Escherichia coli/crescimento & desenvolvimento , Fatores de Terminação de Peptídeos/genética , RNA de Transferência de Glutamina , RNA de Transferência de Ácido Glutâmico , RNA de Transferência de Lisina , Supressão Genética , Temperatura , Alelos , Proteínas de Bactérias/metabolismo , Códon de Terminação , Meios de Cultura , Elementos de DNA Transponíveis , Escherichia coli/genética , Escherichia coli/fisiologia , Proteínas de Escherichia coli/metabolismo , Regulação Bacteriana da Expressão Gênica , Temperatura Alta , Fatores de Terminação de Peptídeos/metabolismo , Fenótipo , RNA de Transferência de Glutamina/química , RNA de Transferência de Glutamina/genética , RNA de Transferência de Glutamina/metabolismo , RNA de Transferência de Ácido Glutâmico/química , RNA de Transferência de Ácido Glutâmico/genética , RNA de Transferência de Ácido Glutâmico/metabolismo , RNA de Transferência de Lisina/química , RNA de Transferência de Lisina/genética , RNA de Transferência de Lisina/metabolismo , Tiouridina/análogos & derivados , Tiouridina/metabolismo
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