The impact of changing the diagnostic algorithm for TB in Manicaland, Zimbabwe.

SETTING: Governmental health facilities performing TB diagnostics in Manicaland, Zimbabwe. OBJECTIVE: To investigate the effect of making Xpert® MTB/RIF the primary TB diagnostic for all patients presenting with presumptive TB on 1) the number of samples investigated for TB, 2) the proportion testing TB-positive, and 3) the proportion of unsuccessful results over time. DESIGN: This retrospective study used data from GeneX-pert downloads, laboratory registers and quality assurance reports between 1 January 2017 and 31 December 2018. RESULTS: The total number of Xpert tests performed in Manicaland increased from 3,967 in the first quarter of 2017 to 7,011 in the last quarter of 2018. Mycobacterium tuberculosis DNA was detected in 4.9-8.6% of the samples investigated using Xpert, with a higher yield in 2017 than in 2018. The overall proportion of unsuccessful Xpert assays due to "no results", errors and invalid results was 6.3%, and highly variable across sites. CONCLUSION: Roll out of more sensitive TB diagnostics does not necessarily result in an increase of microbiologically confirmed TB diagnosis. While the number of samples tested using Xpert increased, the proportion of TB-positive tests decreased. GeneXpert soft- and hardware infrastructure needs to be strengthened to reduce the rate of unsuccessful assays and therefore, costs and staff time.

LIEU: Centres de soins gouvernementaux réalisant des tests diagnostiques de la TB au Manicaland, Zimbabwe. OBJECTIF: Analyser l'effet de l'utilisation du test Xpert® MTB/RIF en tant que test diagnostique principal de la TB chez tous les patients suspects de TB sur 1) le nombre d'échantillons analysés pour TB, 2) la proportion d'échantillons testés positifs à la TB et 3) la proportion de résultats infructueux au fil du temps. MÉTHODE: Cette étude rétrospective a utilisé les données extraites du système GeneXpert, des registres de laboratoire et des rapports d'assurance qualité entre le 1er janvier 2017 et le 31 décembre 2018. RÉSULTATS: Le nombre total de tests Xpert réalisés au Manicaland a augmenté, de 3 967 au premier trimestre 2017 à 7 011 au dernier trimestre 2018. L'ADN de Mycobacterium tuberculosis a été détecté dans 4,9­8,6% des échantillons analysés par test Xpert, avec un rendement plus élevé en 2017 qu'en 2018. La proportion globale de tests Xpert infructueux en raison d'une « absence de résultat ¼, d'erreurs ou de résultats non valides était de 6,3%, avec une forte variation en fonction des sites. CONCLUSION: Le déploiement de tests diagnostiques de la TB plus sensibles n'entraîne pas nécessairement une hausse des diagnostics de TB confirmés microbiologiquement. Alors que le nombre d'échantillons testés par test Xpert a augmenté, la proportion de tests positifs pour la TB a diminué. L'infrastructure du matériel et du logiciel GeneXpert doit être renforcée pour réduire le taux de tests infructueux, et donc les coûts et le temps consacré par le personnel à la réalisation de ces tests.

Diagnosis and treatment of TB patients with rifampicin resistance detected using Xpert(®) MTB/RIF in Zimbabwe.

SETTING: In Zimbabwe, there are concerns about the management of tuberculosis (TB) patients with rifampicin (RMP) resistance diagnosed using Xpert(®) MTB/RIF. OBJECTIVE: To assess linkages between diagnosis and treatment for these patients in Harare and Manicaland provinces in 2014. DESIGN: A retrospective cohort study. RESULTS: Of 20 329 Xpert assays conducted, 90% were successful, 11% detected Mycobacterium tuberculosis and 4.5% showed RMP resistance. Of 77 patients with RMP-resistant TB diagnosed by Xpert, 70% had samples sent to the reference laboratory for culture and drug susceptibility testing (CDST); 53% of the samples arrived. In 21% the samples showed M. tuberculosis growth, and in 17% the DST results were recorded, all of which confirmed RMP resistance. Of the 77 patients, 34 (44%) never started treatment for multidrug-resistant (MDR) TB, with documented reasons being death, loss to follow-up and incorrect treatment. Of the 43 patients who started MDR-TB treatment, 12 (71%) in Harare and 17 (65%) in Manicaland started within 2 weeks of diagnosis. CONCLUSION: Xpert has been rolled out successfully in two Zimbabwe provinces. However, the process of confirming CDST for Xpert-diagnosed RMP-resistant TB works poorly, and many patients are either delayed or never initiate MDR-TB treatment. These shortfalls must be addressed at the programmatic level.

Contexte : Au Zimbabwe, la prise en charge des patients tuberculeux ayant une résistance à la rifampicine (RMP) diagnostiqués par Xpert® MTB/RIF est préoccupante.Objectif : Evaluer les liens entre le diagnostic et le traitement de ces patients dans les provinces de Harare et de Manicaland en 2014.Schéma : Etude rétrospective de cohorte.Résultats : Sur 20 329 tests Xpert, 90% ont été réussis, 11% ont détecté Mycobacterium tuberculosis et 4,5% ont mis en évidence une résistance à la RMP. Il y a eu 77 patients atteints d'une tuberculose (TB) résistante à la RMP diagnostiqués par Xpert. Parmi eux, 70% ont bénéficié d'un envoi d'échantillon au laboratoire de référence pour une culture et un test de pharmacosensibilité (CDST) ; pour 53% d'entre eux, les échantillons sont arrivés à bon port ; pour 21%, les échantillons ont mis en évidence une croissance de M. tuberculosis ; et chez 17%, les résultats du CDST ont été enregistrés et tous ont confirmé la résistance à la RMP. Sur 77 patients, 34 (44%) n'ont jamais mis en route un traitement pour le TB multirésistante (TB-MDR) ; les motifs documentés étaient le décès, la perte de vue ou un traitement incorrect. Des 43 patients qui ont débuté le traitement de TB-MDR, 12 (71%) à Harare et 17 (65%) au Manicaland ont commencé dans les 2 semaines suivant le diagnostic.Conclusion : L'Xpert a été lancé avec succès dans deux provinces du Zimbabwe. Cependant, le processus de confirmation du CDST pour une TB résistante à la RMP diagnostiquée par Xpert ne fonctionne pas bien, et de nombreux patients sont soit traités avec retard, soit ne démarrent jamais le traitement de TB-MDR. Ces problèmes doivent être examinés par le programme.

Marco de referencia: En Zimbabwe, el tratamiento de los pacientes cuyo diagnóstico de tuberculosis (TB) resistante a la rifampicina (RMP) se determina mediante la prueba Xpert® MTB/RIF es fuente de inquietud.Objetivo: Evaluar los nexos entre el diagnóstico y el tratamiento de los pacientes diagnosticados mediante la prueba Xpert en las provincias de Harare y Manicaland en el 2014.Método: Fue este un estudio retrospectivo de cohortes.Resultados: Se obtuvieron resultados satisfactorios en el 90% de las 20 329 pruebas Xpert realizadas; se detectó Mycobacterium tuberculosis en el 11% y el 4,5% reveló resistencia a RMP. Con la prueba Xpert se diagnosticaron 77 casos de TB resistente a RMP y se enviaron muestras del 70% de estos casos al laboratorio de referencia, con el fin de practicar el cultivo y las pruebas se sensibilidad (CDST) a los medicamentos antituberculosos. El 53% de estas muestras llegaron al laboratorio, en un 21% se obtuvo crecimiento de M. tuberculosis y en el 17% de los casos existía un registro de los resultados de la CDST; todos los resultados confirmaron la resistencia a RMP. De los 77 pacientes, 34 nunca comenzaron el tratamiento contra la TB multidrogorresistente (TB-MDR) (44%); las causas documentadas fueron el fallecimiento, la pérdida durante el seguimiento y un tratamiento inadecuado. De los 43 pacientes que iniciaron el tratamiento por TB-MDR, 12 casos en Harare (71%) y 17 casos en Manicaland (65%) lo comenzaron en las 2 primeras semanas después del diagnóstico.Conclusión: El despliegue de la prueba Xpert en dos provincias de Zimbabwe fue satisfactorio. Sin embargo, el mecanismo de confirmación de la resistencia a RMP mediante el CDST en los casos diagnosticados por la prueba Xpert fue deficiente y en muchos pacientes se retrasó el tratamiento de la TB-MDR o nunca se comenzó. Es preciso abordar estas deficiencias en el marco programático.