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Nucleic Acids Res ; 52(12): 7305-7320, 2024 Jul 08.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-38842936

RESUMO

The SorC family of transcriptional regulators plays a crucial role in controlling the carbohydrate metabolism and quorum sensing. We employed an integrative approach combining X-ray crystallography and cryo-electron microscopy to investigate architecture and functional mechanism of two prototypical representatives of two sub-classes of the SorC family: DeoR and CggR from Bacillus subtilis. Despite possessing distinct DNA-binding domains, both proteins form similar tetrameric assemblies when bound to their respective DNA operators. Structural analysis elucidates the process by which the CggR-regulated gapA operon is derepressed through the action of two effectors: fructose-1,6-bisphosphate and newly confirmed dihydroxyacetone phosphate. Our findings provide the first comprehensive understanding of the DNA binding mechanism of the SorC-family proteins, shedding new light on their functional characteristics.


Assuntos
Bacillus subtilis , Proteínas de Bactérias , Microscopia Crioeletrônica , Modelos Moleculares , Proteínas Repressoras , Proteínas de Bactérias/química , Proteínas de Bactérias/metabolismo , Proteínas de Bactérias/genética , Cristalografia por Raios X , Bacillus subtilis/genética , Bacillus subtilis/metabolismo , Proteínas Repressoras/química , Proteínas Repressoras/metabolismo , Proteínas Repressoras/genética , Ligação Proteica , Multimerização Proteica , DNA/química , DNA/metabolismo , Sítios de Ligação , Regulação Bacteriana da Expressão Gênica , DNA Bacteriano/metabolismo , DNA Bacteriano/química , DNA Bacteriano/genética , Proteínas de Ligação a DNA/química , Proteínas de Ligação a DNA/metabolismo , Proteínas de Ligação a DNA/genética , Óperon/genética , Frutosedifosfatos
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