RESUMO
The genetic background of the Brazilian population is mainly characterized by three parental populations: European, African, and Native American. The aim of this study was to overview the genetic ancestry estimates for different Brazilian geographic regions and analyze factors involved in these estimates. In this systematic scoping review were included 51 studies, comprehending 81 populations of 19 states from five regions of Brazil. To reduce the potential of bias from studies with different sampling methods, we calculated the mean genetic ancestry weighted by the number of individuals. The weighted mean proportions of European, African, and Native American ancestries were 68.1%, 19.6%, and 11.6%, respectively. At the regional level, the highest European contribution occurred in the South, while the highest African and Native American contributions occurred in the Northeastern and Northern regions, respectively. Among states in the Northeast region, Bahia and Ceará showed significant differences, suggesting distinct demographic histories. This review contributes for a broader understanding of the Brazilian ancestry and indicates that the ancestry estimates are influenced by the type of molecular marker and the sampling method.
RESUMO
Plasmodium vivax has been reported to cause severe malaria, and one of the main resulting complications is anemia. Considering that P. vivax infects only young erythrocytes, anemia has been associated with the destruction of infected and non-infected erythrocytes. However, few studies have focused on understanding the relationship between the pathogenesis of P. vivax malaria and human genetic polymorphisms. Although ABO groups seem to influence the outcome of Plasmodium falciparum malaria, the association between P. vivax and ABO blood groups has been minimally investigated. Thus, we investigate the correlation between ABO blood groups and anemia induced by P. vivax infection. Five single nucleotide polymorphisms at the ABO gene were genotyped by PCR-RFLP and Real-Time PCR in P. vivax-infected subjects. The ABO blood types were associated with the hematological data of the patients. Our main finding was that type O infected-individuals showed lower levels of hemoglobin and hematocrit compared to type A-infected individuals. The correlation between ABO blood groups and hemoglobin levels remained significant when a multiple linear regression was applied with the possible confounding effects of clinical-epidemiologic variables taken into account. The finding that type O individuals have a higher frequency of anemia is a first step to understand the mechanisms involved in malaria anemia, which could be associated to increased destruction of type O erythrocytes.
Assuntos
Sistema ABO de Grupos Sanguíneos/genética , Anemia/patologia , Eritrócitos/patologia , Hemoglobinas/genética , Malária Vivax/patologia , Sistema ABO de Grupos Sanguíneos/metabolismo , Adulto , Anemia/complicações , Anemia/genética , Anemia/parasitologia , Eritrócitos/parasitologia , Expressão Gênica , Genótipo , Hemoglobinas/metabolismo , Interações Hospedeiro-Parasita , Humanos , Modelos Lineares , Malária Vivax/complicações , Malária Vivax/genética , Malária Vivax/parasitologia , Masculino , Plasmodium vivax/crescimento & desenvolvimento , Plasmodium vivax/patogenicidade , Reação em Cadeia da Polimerase , Polimorfismo de Fragmento de Restrição , Polimorfismo de Nucleotídeo ÚnicoRESUMO
The molecular basis of Plasmodium vivax chloroquine (CQ) resistance is still unknown. Elucidating the molecular background of parasites that are sensitive or resistant to CQ will help to identify and monitor the spread of resistance. By genotyping a panel of molecular markers, we demonstrate a similar genetic variability between in vitro CQ-resistant and sensitive phenotypes of P. vivax parasites. However, our studies identified two loci (MS8 and MSP1-B10) that could be used to discriminate between both CQ-susceptible phenotypes among P. vivax isolates in vitro. These preliminary data suggest that microsatellites may be used to identify and to monitor the spread of P. vivax-resistance around the world.
Assuntos
Cloroquina/farmacologia , DNA de Protozoário/isolamento & purificação , Resistência a Medicamentos/genética , Variação Genética , Plasmodium vivax/efeitos dos fármacos , Plasmodium vivax/genética , Brasil/epidemiologia , Doenças Endêmicas/estatística & dados numéricos , Marcadores Genéticos , Humanos , Malária Vivax/sangue , Malária Vivax/epidemiologia , Testes de Sensibilidade Parasitária , Fenótipo , Reação em Cadeia da Polimerase , Distribuição AleatóriaRESUMO
The molecular basis of Plasmodium vivax chloroquine (CQ) resistance is still unknown. Elucidating the molecular background of parasites that are sensitive or resistant to CQ will help to identify and monitor the spread of resistance. By genotyping a panel of molecular markers, we demonstrate a similar genetic variability between in vitro CQ-resistant and sensitive phenotypes of P. vivax parasites. However, our studies identified two loci (MS8 and MSP1-B10) that could be used to discriminate between both CQ-susceptible phenotypes among P. vivax isolates in vitro. These preliminary data suggest that microsatellites may be used to identify and to monitor the spread of P. vivax-resistance around the world.
Assuntos
Humanos , Cloroquina/farmacologia , DNA de Protozoário/isolamento & purificação , Resistência a Medicamentos/genética , Variação Genética , Plasmodium vivax/efeitos dos fármacos , Plasmodium vivax/genética , Brasil/epidemiologia , Doenças Endêmicas/estatística & dados numéricos , Marcadores Genéticos , Malária Vivax/sangue , Malária Vivax/epidemiologia , Testes de Sensibilidade Parasitária , Fenótipo , Reação em Cadeia da Polimerase , Distribuição AleatóriaRESUMO
Cepas de Plasmodium resistentes a diferentes drogas têm sido descritas ao redor do mundo. Embora os mecanismos de desenvolvimento de resistência não sejam bem conhecidos, sabe-se que defeitos nos sistemas de reparo do DNA podem estar envolvidos. Esses defeitos estão relacionados principalmente a mutações nas enzimas do sistema de reparo de mal pareamento do DNA ou mismatch repair(MMR) e já foram descritos em populações naturais de diversos organismos. Devido ao conhecimento limitado sobre o sistema MMR de Plasmodium, faz-se necessário um amplo estudo sobre os genes que codificam as proteínas envolvidas nesse sistema. Neste trabalho, foi realizado um estudo sobre as enzimas envolvidas no sistema de reparo do mal pareamento do DNA em Plasmodium: variabilidade intra e interespecífica em Plasmodium, principalmente nos domínios funcionais, e comparação entre níveis de expressão entre cepas/isolados de P. falciparum. Os parasitos foram também avaliados quanto ao número de cópias e expressão dos genes gch-1 e mdr1. Foram identificadas proteínas pertencentes às classes MSH2,MSH6, MLH1 e PMS1.
As sequências de proteínas mostraram-se muito conservadas, tanto entre o gênero Plasmodium, quanto em relação a outros organismos distantes evolutivamente. Foi encontrada um proteína homóloga a MutSque possui os domínios I e V, mas ainda não identificada quanto à sua classificação.O gene codificador desta proteína teve sua expressão confirmada neste e em outros trabalhos. Alguns SNPs foram encontrados em cepas/isolados depositados no PlasmoDB, no entanto, o sequenciamento da região que compreende os principais domínios funcionais apontou apenas 1 SNP na proteína PMS1. Os genes estudados, em sua maioria, apresentaram-se mais expressos entre 10 e 30 horas após a sincronização. W2 e 3D7 apresentam 2 cópias do genes gch-1 e mdr1. BHZ apresentou apenas 1 cópia do mdr1. Os resultados da análise de expressão desses genes ligados à resistência concordam com os resultados encontrados para o número de cópias gênicas. Este estudo fornece uma análise ampla das principais enzimas do MMR e será importante para estudos futuros do papel funcional destas enzimas e seu envolvimento no desenvolvimento de resistência às drogas
Assuntos
Humanos , Animais , Cobaias , Camundongos , Resistência a Medicamentos , Malária Falciparum/genética , Plasmodium falciparum/enzimologiaRESUMO
Cepas de Plasmodium resistentes a diferentes drogas têm sido descritas ao redor do mundo. Embora os mecanismos de desenvolvimento de resistência não sejam bem conhecidos, sabe-se que defeitos nos sistemas de reparo do DNA podem estar envolvidos. Esses defeitos estão relacionados principalmente a mutações nas enzimas do sistema de reparo de mal pareamento do DNA ou mismatch repair(MMR) e já foram descritos em populações naturais de diversos organismos. Devido ao conhecimento limitado sobre o sistema MMR de Plasmodium, faz-se necessário um amplo estudo sobre os genes que codificam as proteínas envolvidas nesse sistema. Neste trabalho, foi realizado um estudo sobre as enzimas envolvidas no sistema de reparo do mal pareamento do DNA em Plasmodium: variabilidade intra e interespecífica em Plasmodium, principalmente nos domínios funcionais, e comparação entre níveis de expressão entre cepas/isolados de P. falciparum. Os parasitos foram também avaliados quanto ao número de cópias e expressão dos genes gch-1 e mdr1. Foram identificadas proteínas pertencentes às classes MSH2,MSH6, MLH1 e PMS1. As sequências de proteínas mostraram-se muito conservadas, tanto entre o gênero Plasmodium, quanto em relação a outros organismos distantes evolutivamente. Foi encontrada um proteína homóloga a MutSque possui os domínios I e V, mas ainda não identificada quanto à sua classificação.O gene codificador desta proteína teve sua expressão confirmada neste e em outros trabalhos. Alguns SNPs foram encontrados em cepas/isolados depositados no PlasmoDB, no entanto, o sequenciamento da região que compreende os principais domínios funcionais apontou apenas 1 SNP na proteína PMS1. Os genes estudados, em sua maioria, apresentaram-se mais expressos entre 10 e 30 horas após a sincronização. W2 e 3D7 apresentam 2 cópias do genes gch-1 e mdr1. BHZ apresentou apenas 1 cópia do mdr1. Os resultados da análise de expressão desses genes ligados à resistência concordam com os resultados encontrados para o número de cópias gênicas. Este estudo fornece uma análise ampla das principais enzimas do MMR e será importante para estudos futuros do papel funcional destas enzimas e seu envolvimento no desenvolvimento de resistência às drogas.