Phylogenetic relationships of the Mangrove Hummingbird, "Amazilia" boucardi (Apodiformes: Trochilidae) of Costa Rica / Relaciones filogenéticas del Colibrí manglero "Amazilia" boucardi (Apodiformes: Trochilidae) de Costa Rica

Abstract Introduction: A recent revision of the generic classification of the Trochilidae based on DNA sequences revealed many inconsistencies with the current generic classification, largely based on plumage characters subject to homoplasy, especially in the Trochilini, the largest tribe. A thorough generic reorganization brought the classification into accord with the phylogeny, but due to lack of genetic data, two species remained unclassified. One of these was the Mangrove Hummingbird, "Amazilia" boucardi, endemic to Costa Rica and included in the IUCN red list of threatened species. Objective: To obtain molecular evidence to clarify the generic relationships of "A." boucardi. Methods: We isolated DNA from tissues of this species and amplified 4 nuclear and 4 mitochondrial fragments and compared these with homologous fragments from 56 species in the Trochilini, constructing phylogenetic trees with maximum likelihood and Bayesian methods. Results: Our phylogenetic analyses confirmed the placement of boucardi in the Trochilini and definitely excluded it from Amazilia but placed it with high confidence in the genus Chrysuronia Bonaparte, 1850, within which its closest relative is C. coeruleogularis, which also inhabits mangroves. Conclusions: Our genetic data based on nuclear and mitochondrial regions clearly indicate the relationship of A. boucardi and L. coeruleogularis. Moreover, it is also supported by their habitat distribution in the mangroves of the Pacific coast of Costa Rica and Western Panama. Therefore, we suggested to exclude A. boucardi as "incertae sedis".

Resumen Introducción: Una revisión reciente de la clasificación de la familia Trochilidae con base en secuencias de ADN demostró muchas incongruencias con la clasificación genérica previa, que había sido hecho con base en caracteres del plumaje muy sujetos a homoplasia, especialmente en la tribu más grande, Trochillini. Una reorganización de los géneros logró llevar su clasificación genérica a la concordancia con la filogenia, pero debido a la ausencia de datos genéticos, dos especies permanecieron sin clasificar. Una de estas fue el colibrí de manglar Amazilia boucardi, una especie endémica de Costa Rica, considerada como amenazada en la lista roja de la UICN. Objetivo: Obtener evidencia molecular para esclarecer las relaciones genéricas de A. boucardi. Métodos: Se aisló ADN de tejidos de esta especie y se amplificaron 4 fragmentos de ADN del núcleo y 5 de la mitocondria, y se compararon con fragmentos homólogos de 56 especies en la tribu Trochillini, generando árboles filogenéticos con métodos de máxima verosimilitud y bayesiano. Resultados: Los análisis filogénticos obtenidos confirmaron la ubicación de boucardi en Trochilini y definitivamente la excluyó del género Amazilia, pero la ubicó con un alto grado de confianza en el género Chrysuronia Bonaparte, 1850, dentro los cuales su pariente más cercano es C. coeruleogularis, que también habita manglares. Conclusiones: Nuestros datos genéticos basados en regiones nucleares y mitocondriales indican claramente la relación entre A. boucardi and L. coeruleogularis. Es más, lo anterior se sustenta por su distribución en los manglares de la costa Pacífica de Costa Rica y oeste de Panamá. Por lo tanto, sugerimos excluir a A. boucardi como "incertae sedis".

Integrating socioeconomic and ecological data into restoration practice.

Driven by the United Nations Decade on Restoration and international funding initiatives, such as the Mangrove Breakthrough, investment in mangrove restoration is expected to increase. Yet, mangrove restoration efforts frequently fail, usually because of ad hoc site-selection processes that do not consider mangrove ecology and the socioeconomic context. Using decision analysis, we developed an approach that accounts for socioeconomic and ecological data to identify sites with the highest likelihood of mangrove restoration success. We applied our approach in the Biosphere Reserve Marismas Nacionales Nayarit, Mexico, an area that recently received funding for implementing mangrove restoration actions. We identified 468 potential restoration sites, assessed their restorability potential based on socioeconomic and ecological metrics, and ranked sites for implementation with spatial optimization. The metrics we used included favorable conditions for propagules to establish and survive under sea-level rise, provision of ecosystem services, and community dynamics. Sites that were selected based on socioeconomic or ecological metrics alone had lower likelihood of mangrove restoration success than sites that were selected based on integrated socioeconomic and ecological metrics. For example, selecting sites based on only socioeconomic metrics captured 16% of the maximum attainable value of functioning mangroves able to provide propagules to potential restoration sites, whereas selecting sites based on ecological and socioeconomic metrics captured 46% of functioning mangroves. Our approach was developed as part of a collaboration between nongovernmental organizations, local government, and academics under rapid delivery time lines given preexisting mangrove restoration implementation commitments. The systematic decision process we used integrated socioeconomic and ecological considerations even under short delivery deadlines, and our approach can be adapted to help mangrove restoration site-selection decisions elsewhere.

Integración de datos socioeconómicos y ecológicos en las prácticas de restauración Resumen Se espera que la inversión en la restauración de los manglares incremente debido a la Década de Restauración de las Naciones Unidad y las iniciativas internacionales de financiamiento, como The Mangrove Breakthrough. Sin embargo, los esfuerzos de restauración de manglares fallan con frecuencia, generalmente por los procesos de selección de sitios ad­hoc que no consideran la ecología del manglar y el contexto socioeconómico. Usamos el análisis de decisiones para desarrollar una estrategia que considera los datos socioeconómicos y ecológicos para identificar los sitios con mayor probabilidad de éxito de restauración. Aplicamos nuestra estrategia en la Reserva de la Biósfera Marismas Nacionales Nayarit, México, un área que recibió financiamiento reciente para la restauración del manglar. Identificamos 468 sitios potencialmente restaurables, evaluamos su potencial de restauración con base en medidas ecológicas y socioeconómicas y clasificamos los sitios para la implementación con la optimización espacial. Las medidas que usamos incluían las condiciones favorables para que los propágulos se establezcan y sobrevivan con el incremento en el nivel del mar, el suministro de servicios ambientales y las dinámicas de la comunidad. Los sitios seleccionados sólo con base en las medidas ecológicas o socioeconómicas tuvieron una menor probabilidad de éxito de restauración que los sitios que se seleccionaron con base en medidas socioeconómicas y ecológicas integradas. Por ejemplo, la selección de sitios con base sólo en las medidas socioeconómicas capturó el 16% del máximo valor alcanzable de manglares funcionales capaces de proporcionar propágulos a los sitios potenciales de restauración, mientras que la selección basada en medidas ecológicas y socioeconómicas capturó el 46% de los manglares funcionales. Desarrollamos nuestra estrategia como parte de una colaboración entre organizaciones no gubernamentales, el gobierno local y académicos sujetos a una fecha pronta de entrega debido a los compromisos preexistentes para la restauración de manglares. El proceso de decisión sistemática que usamos integró las consideraciones ecológicas y socioeconómicas incluso con plazos cortos de entrega. Nuestra estrategia puede adaptarse para apoyar en la selección de sitios de restauración de manglares en otros sitios.

Effects of perceptions of forest change and intergroup competition on community-based conservation behaviors.

Approximately one quarter of the earth's population directly harvests natural resources to meet their daily needs. These individuals are disproportionately required to alter their behaviors in response to increasing climatic variability and global biodiversity loss. Much of the ever-ambitious global conservation agenda relies on the voluntary uptake of conservation behaviors in such populations. Thus, it is critical to understand how such individuals perceive environmental change and use conservation practices as a tool to protect their well-being. We developed a participatory mapping activity to elicit spatially explicit perceptions of forest change and its drivers across 43 mangrove-dependent communities in Pemba, Tanzania. We administered this activity along with a questionnaire regarding conservation preferences and behaviors to 423 individuals across those 43 communities. We analyzed these data with a set of Bayesian hierarchical statistical models. Perceived cover loss in 50% of a community's mangrove area drove individuals to decrease proposed limits on fuelwood bundles from 2.74 (forest perceived as intact) to 2.37 if participants believed resultant gains in mangrove cover would not be stolen by outsiders. Conversely, individuals who believed their community mangrove forests were at high risk of theft loosened their proposed harvest limits from 1.26 to 2.75 bundles of fuelwood in response to the same perceived forest decline. High rates of intergroup competition and mangrove loss were thus driving a self-reinforcing increase in unsustainable harvesting preferences in community forests in this system. This finding demonstrates a mechanism by which increasing environmental decline may cause communities to forgo conservation practices, rather than adopt them, as is often assumed in much community-based conservation planning. However, we also found that when effective boundaries were present, individuals were willing to limit their own harvests to stem such perceived decline.

Efectos de las percepciones del cambio forestal y la competencia intergrupal en los comportamientos de conservación comunitarios Resumen Aproximadamente una cuarta parte de la población mundial aprovecha directamente los recursos naturales para satisfacer sus necesidades diarias. Estos individuos se ven desproporcionadamente obligados a alterar sus comportamientos en respuesta a la creciente variabilidad climática y la pérdida de biodiversidad global. Gran parte de la ambiciosa agenda de conservación global se basa en la adopción voluntaria de comportamientos de conservación en dichas poblaciones. Por lo tanto, es fundamental comprender cómo esas personas perciben el cambio ambiental y utilizan las prácticas de conservación como herramienta para proteger su bienestar. Desarrollamos una actividad de mapeo participativo para generar percepciones espacialmente explícitas del cambio forestal y sus causantes en 43 comunidades dependientes de manglares en Pemba, Tanzania. Administramos esta actividad junto con un cuestionario sobre preferencias y comportamientos de conservación a 423 personas en esas 43 comunidades. Analizamos estos datos mediante un conjunto de modelos estadísticos jerárquicos bayesianos. La pérdida de cobertura percibida en el 50% del área de manglares de una comunidad llevó a los individuos a reducir los límites propuestos para los paquetes de leña de 2.74 (bosque percibido como intacto) a 2.37 si los participantes creían que las ganancias resultantes en la cobertura de manglares no serían robadas por personas ajenas a la comunidad. Por el contrario, las personas que creían que los bosques de manglares de su comunidad corrían un alto riesgo de robo flexibilizaron los límites de cosecha propuestos de 1.26 a 2.75 haces de leña en respuesta a la misma disminución percibida del bosque. Por lo tanto, las altas tasas de competencia entre grupos y pérdida de manglares estaban impulsando un aumento, que se auto reforzaba, en las preferencias de aprovechamiento insostenibles en los bosques comunitarios de este sistema. Este hallazgo muestra un mecanismo por el cual el creciente deterioro ambiental puede hacer que las comunidades renuncien a las prácticas de conservación, en lugar de adoptarlas, como a menudo se supone en gran parte de la planificación de la conservación basada en la comunidad. Sin embargo, también encontramos que cuando existían límites efectivos, los individuos estaban dispuestos a restringir sus propias cosechas para frenar esa disminución percibida.

Proporción sexual y hermafroditismo del molusco, Anadara tuberculosa (Bivalvia: Arcidae) en Panamá / Sexual proportion and hermaphroditism of the mollusc, Anadara tuberculosa (Bivalvia: Arcidae) in Panama

Introducción: El bivalvo Anadara tuberculosa es un recurso pesquero y económico importante en el Pacífico Este Tropical. La proporción sexual varia a lo largo de su área de distribución, con casos de aparición de hermafroditismo, ocasional para algunas poblaciones, normal en otras. Estas características podrían ser una respuesta a presiones antropogénicas y ambientales. Objetivo: Evaluar la proporción sexual y el hermafroditismo en la especie en el Pacífico de Panamá. Métodos: Se analizó información reproductiva de A. tuberculosa generada entre 1994 y 2020 para el Golfo de Montijo, así como datos de 2017 para el manglar de David. Se aplicaron procedimientos macroscópicos, contrastados con histológicos y se generó un factor de corrección para ajustar la proporción sexual macroscópica, debido al efecto, sobre la proporción sexual, que ocasiona los organismos indeterminados. Resultados: Para el Golfo de Montijo, la histología indicó una proporción sexual hembra a macho de 1:1 hasta 3.2:1, entre 1994 y 2017, mientras que la macroscopía varió de 1.9:1 a 5.1:1 entre 2004 y 2020. Para el manglar de David, la histología indicó una proporción sexual de 3.7:1, y de 7.9:1 por macroscopía en el 2017. En ambas localidades, especímenes más grandes mostraron mayor variación en la proporción sexual, pese a la técnica implementada, así como hermafroditismo protándrico no casual en el 2017. Conclusiones: La aparición del hermafroditismo protándrico y los cambios en la proporción sexual indican que la población de A. tuberculosa, en ambas localidades, está respondiendo a presiones antropogénicas y ambientales.

Introduction: The bivalve Anadara tuberculosa is an important fishery in the Eastern Tropical Pacific. The sex ratio varies along its geographic range and there are cases of hermaphroditism, occasional in some populations, normal in others. These characteristics may be a response to anthropogenic and environmental pressure. Objective: To evaluate sex ratio and hermaphroditism of the species in the Panamanian Pacific. Methods: Data on reproductive features of A. tuberculosa generated between 1994 and 2020 for Gulf of Montijo, as well as 2017 data from mangroves of David was analyzed. Macroscopic diagnosis of individual sex is sensitive to the problem of indeterminate individuals, which in turn can skew the sex ratio analysis; therefore, the macroscopic method was compared with histological sections to generate a correction factor to adjust the macroscopically determined sex ratio. Results: For Montijo, histology indicated that the female to male sex ratio ranged from 1:1 to 3.2:1 between 1994 and 2017, while macroscopy indicated 1.9:1 to 5.1:1 between 2004 and 2020. For David, histology indicated a ratio of 3.7:1, and macroscopy 7.9:1. At both localities, larger specimens had more sex ratio variation, independently of the technique, and there was non-casual protandric hermaphroditism in 2017. Conclusion: The occurrence of protandric hermaphroditism and sex ratio changes suggest anthropogenic and environmental pressure in all populations.

Using metapopulation theory for practical conservation of mangrove endemic birds.

As a landscape becomes increasingly fragmented through habitat loss, the individual patches become smaller and more isolated and thus less likely to sustain a local population. Metapopulation theory is appropriate for analyzing fragmented landscapes because it combines empirical landscape features with species-specific information to produce direct information on population extinction risks. This approach contrasts with descriptions of habitat fragments, which provide only indirect information on risk. Combining a spatially explicit metapopulation model with empirical data on endemic species' ranges and maps of habitat cover, we calculated the metapopulation capacity-a measure of a landscape's ability to sustain a metapopulation. Mangroves provide an ideal model landscape because they are of conservation concern and their patch boundaries are easily delineated. For 2000-20015, we calculated global metapopulation capacity for 99 metapopulations of 32 different bird species endemic to mangroves. Northern Australia and Southeast Asia had the highest richness of mangrove endemic birds. The Caribbean, Pacific coast of Central America, Madagascar, Borneo, and isolated patches in Southeast Asia in Myanmar and Malaysia had the highest metapopulation losses. Regions with the highest loss of habitat area were not necessarily those with the highest loss of metapopulation capacity. Often, it was not a matter of how much, but how the habitat was lost. Our method can be used by managers to evaluate and prioritize a landscape for metapopulation persistence.

Uso de la Teoría de Metapoblaciones para la Conservación Práctica de las Aves Endémicas de Manglares Resumen A medida que un paisaje se fragmenta cada vez más debido a la pérdida de hábitat, los parches se vuelven más pequeños y aislados y, por lo tanto, menos propensos a sostener a una población local. La teoría de metapoblaciones es adecuada para analizar paisajes fragmentados porque combina características empíricas del paisaje con información de cada especie para producir información directa sobre los riesgos de extinción de la población. Este enfoque contrasta con las descripciones de los fragmentos de hábitat que solo proporcionan información directa sobre el riesgo. Mediante la combinación de un modelo metapoblacional espacialmente explícito con datos empíricos de los rangos de distribución de especies endémicas y mapas de la cobertura del hábitat, calculamos la capacidad de la metapoblación - una medida de la capacidad del paisaje para sostener una metapoblación. Los manglares proporcionan un paisaje modelo ideal porque son de interés para la conservación y los límites de los parches son delineados fácilmente. Calculamos la capacidad de la metapoblación global para el período 2000-2015 de 99 metapoblaciones de 32 especies de aves endémicas de manglares. El norte de Australia y el sudeste de Asia tuvieron la mayor riqueza de aves endémicas de manglares. El Caribe, la costa del Pacífico de Centroamérica, Madagascar, Borneo y parches aislados en el sudeste de Asia en Myanmar y Malasia tuvieron las mayores pérdidas de metapoblaciones. Las regiones con mayor pérdida hábitat fueron necesariamente aquellas con mayor pérdida de capacidad de la metapoblación. A menudo no era una cuestión de cuánto, sino cómo se perdió el hábitat. Nuestro método se puede utilizar por manejadores para evaluar y priorizar un paisaje para la persistencia de la metapoblación.

Fish assemblages in three fringed mangrove bays of Santa Cruz Island, Galapagos Marine Reserve / Ensamblaje de peces en tres bahías con bordes de manglar en la Isla Santa Cruz, Reserva Marina de Galápagos

Abstract Mangrove-fringed bays are highly variable ecosystems that provide critical habitats for fish species. In this study we assessed the fish assemblage in three mangrove-fringed bays (Punta Rocafuerte, Saca Calzón and Garrapatero) in the Southeast side of Santa Cruz Island, Galapagos Marine Reserve. Using gillnets, we carried out a total of 108 fieldtrips from January 2010 to December 2011. A total of 1 773 bony and 740 cartilaginous fishes belonging to 26 species and 15 families were identified at the same sampling sites. Species richness was higher in the protected bay (Garrapatero) than in those open to fishing (Punta Rocafuerte, Saca Calzón). Blacktip sharks (Carcharhinus limbatus, n= 729), Thoburn's mullets (Mugil thoburni, n= 492), Peruvian mojarras (Diapterus peruvianus, n= 440), milkfish (Chanos chanos, n= 206) and the yellow fin mojarras (Gerres cinereus, n= 197) were the most common species across sites and season (cold and warm). The abundance of the most common species varied seasonally, with C. limbatus and C. chanos being more abundant in the warm season (December to April), and M. thoburni, C. limbatus and G. cinereus in the cold season (June to October). Temperature was the most important driver of abundance in C. limbatus and C. chanos, while salinity influenced Umbrina galapagorum. This study represents the first evaluation of the fish assemblage composition and dynamics in mangrove-fringed bays in the Galapagos Marine Reserve. Rev. Biol. Trop. 66(2): 674-687. Epub 2018 June 01.

Resumen Las bahías de manglar son ecosistemas muy variables que proveen hábitats críticos para especies de peces. En este estudio se evaluó los ensamblajes de peces de tres bahías de manglar (Punta Rocafuerte, Saca Calzón y Garrapatero) ubicadas en el sureste de la isla Santa Cruz, Reserva Marina de Galápagos. Usando redes de trasmallos iguales a los usados por la pesca artesanal, se llevaron a cabo un total de 108 salidas de campo entre enero 2010 y diciembre 2011. Un total 1 773 peces óseos y 740 peces cartilaginosos correspondiendo a 26 especies y 15 familias fueron capturados, identificados y liberados con vida. La riqueza de especies fue mayor en Garrapatero (sitio protegido) que en Punta Rocafuerte y Saca Cazón (sitios abiertos a la pesca). Las mayores capturas estuvieron representadas por el tiburón punta negra (Carcharhinus limbatus; n= 729), seguido la lisa rabo negro (Mugil thoburni; n= 492), la mojarra peruana (Diapterus peruvianus; n= 440), la diabla (Chanos chanos; n= 206) y la mojarra rayada (Gerres cinereus; n= 197). A pesar que éstas especies fueron consistentemente las más importantes a través de los sitios y temporadas (caliente y fría), se observó una mayor abundancia de C. limbatus y C. chanos durante la temporada caliente (enero a abril), y de M. thoburni, C. limbatus y G. cinereus durante la temporada fría (junio a octubre). La temperatura fue determinada como el factor más importante que influye en la abundancia de C. limbatus y C. Chanos, mientras la salinidad lo fue para Umbrina galapagorum. Este estudio representa una importante contribución para el entendimiento de la composición de los ensamblajes de peces en las bahías de manglar de la Reserva Marina de Galápagos.

¿Influyen las aves migratorias neárticas en el patrón estacional de aves de los humedales costeros? / Do influence Nearctic migratory birds in the seasonal pattern of coastal wetlands birds?

Si la llegada en primavera-verano de las aves limícolas migratorias neárticas influye en el incremento de la riqueza y abundancia de los ensambles de aves en los humedales costeros entonces, tanto la riqueza como la abundancia de este grupo de aves disminuirán hacia el otoño. Para comprobarlo se usó como modelo de estudio al Manglar San Pedro de Vice donde se estableció que la disminución de la riqueza de aves en otoño podría deberse al retorno de las especies migratorias neárticas hacia el hemisferio norte. Por tanto, el objetivo fue determinar la disminución de la riqueza y abundancia de aves limícolas migratorias neárticas. Se realizaron 10 muestreos quincenales entre diciembre del 2010 y abril del 2011, recorriendo una distancia de 4.5 km desde el norte del canal de marea preferentemente cuando la marea estaba bajando. La disminución de la riqueza se analizó con una regresión de Poisson, la disminución de la abundancia se hizo a través de los promedios de abundancias con un modelo lineal generalizado. Se registraron 19 especies de aves limícolas consideradas como migratorias neárticas. La riqueza de especies y la abundancia mostraron una disminución estadísticamente significativa de acuerdo a los intervalos de confianza de las pendientes respectivas. Se concluye que las aves limícolas migratorias neárticas sí influyen en los patrones estacionales de los ensambles de aves en los humedales costeros en Perú

If the spring-summer arrival of migratory Nearctic waders influences the increase in richness and abundance of bird assemblages in coastal wetlands then both the richness and abundance of this group of birds will decline by the fall. To verify this, the San Pedro de Vice mangrove was used as a model of study where it was established that the fall in bird species in autumn could be due to the return of migratory species to the northern hemisphere. Therefore, the objective was to determine the decrease in richness and abundance of migratory Nearctic waders. Ten biweekly surveys were conducted between December 2010 and April 2011, covering a distance of 4.5 km from the north of the tidal channel, preferably when the tide was descending. The decrease in richness was analyzed with a Poisson regression, the decrease in abundance was done through the abundance mean with a generalized linear model. There were 19 species of waders considered as migratory Nearctic. Species richness and abundance showed a statistically significant decrease according to the confidence intervals of the respective slopes. It is concluded that migratory Nearctic wader influence the seasonal patterns of bird assemblages in coastal wetlands in Peru.

Estimation of Anadara tuberculosa genetic diversity in five mangroves from Tumaco, using Cytochrome oxidase I enzyme / Estimación de la diversidad genética de Anadara tuberculosa en cinco manglares de Tumaco, utilizando la enzima citocromo oxidasa I

ABSTRACT Objective . To estimate the genetic diversity of the Anadara tuberculosa en five mangrove swams of Tumaco, Nariño, Colombia using as a mitocondrial molecular marker the cytochromo oxidase sub-unit I (COI). Materials and methods. A total of 50 individuals were collected from the San Jorge, La Tiburonera, El Pajal, La Playa y Bajito Vaquería mangrove swamps, randomly selecting 10 specimens of each zone. The tissue sample was worked with absolute alcohol at ambient temperature in microtubes. DNA was extracted, and the mitocondrial DNA was amplified using the PCR technique (polymerase chain reaction). The amplified and quantified products of PCR were sequenced on both sides (Macrogen). Each one of the obtained sequences was edited and aligned. Later, the parameters of genetic diversity (haplotypical and nucleotidical) were measured, and the analysis of distribution between frequency pairs (Mistmach distribution) was elaborated. Finally, the analysis of nucleotidic variation and population structure (AMOVA) was completed. Results. The amplified product gene weighed 710 bp. The haplotypical diversity reported for all the populations was high (0.683±0.060) and the reported nucleotídical diversity was low for all the populations (0.040±0.020). The AMOVA results indicate that the variance amongst populations is low (4.20%) and that the variance within populations is high (95.80%). Conclusions. The studied populations are not structured and although there is a decrease of natural banks, the genetic diversity is high.

RESUMEN Objetivo . Estimar la diversidad genética de Anadara tuberculosa en cinco manglares de Tumaco Nariño, Colombia utilizando como marcador molecular mitocondrial la subunidad I de la citocromo oxidasa (COI). Materiales y métodos. Se colectaron en total 50 individuos de los manglares San Jorge, La Tiburonera, El Pajal, La Playa y Bajito Vaquería, tomando 10 ejemplares al azar de cada zona. La muestra de tejido se fijó con alcohol absoluto a temperatura ambiente en microtubos. Se extrajo y amplificó el ADN mitocondrial mediante la técnica de PCR (Polymerase Chain Reaction). Los productos de PCR amplificados y cuantificados se secuenciaron por ambos lados (Macrogen). Una vez se obtuvo las secuencias, se editó y alineo cada secuencia. Posteriormente, se midió los parámetros de diversidad genética (haplotípica y nucleotídica) y se elaboró el análisis de distribución entre pares de frecuencias (Mistmach distribution). Finalmente se efectuó el análisis de variación nucleotídica y la estructura poblacional (AMOVA). Resultados. El gen amplificado tuvo una longitud de 710 pb. La diversidad haplotípica reportada para todas las poblaciones fue alta (0.683±0.060) y la diversidad nucleotídica reportada fue baja para todas las poblaciones (0.040±0.020). Los resultados del AMOVA indican que la varianza entre poblaciones es baja (4.20%) y la varianza dentro de las poblaciones es alta (95.80%). Conclusiones. Las poblaciones estudiadas no se encuentran estructuradas y a pesar de la disminución de los bancos naturales de las poblaciones de Anadara tuberculosa, se estima que la diversidad genética es alta.

Cambios en la cobertura de manglares en Bahía Culebra, Pacífico Norte de Costa Rica (1945-2010) / Changes in mangrove coverage in Culebra Bay, North Pacific of Costa Rica (1945-2010)

ResumenLos manglares tienen gran importancia ecológica, económica, riqueza natural y prestan servicios ambientales. No obstante, son amenazados por la sobreexplotación, la contaminación y el cambio de uso de suelo. Costa Rica tiene manglares en las costas pacífica y caribeña. Según algunos estudios, la cobertura de manglar ha ido disminuyendo desde la década de 1980. Debido a que estos datos no son actualizados y se basan en estimaciones poco precisas, es necesario hacer una valoración de la extensión actual y la variación de la cobertura en los últimos años, que permita determinar cambios. En esta investigación se estudió la cobertura de dos manglares ubicados en Bahía Culebra, Pacífico Norte: Iguanita y Playa Panamá. Se usaron fotografías e imágenes de satélite para un período de 65 años (1945-2010). Se encontraron cambios espaciotemporales en la cobertura de manglar, bosques adyacentes y áreas sin vegetación. Las menores coberturas de manglar se registraron en la década de 1970, pero aumentaron en años posteriores. Los cambios en la cobertura de bosque alrededor de los manglares de Iguanita y Playa Panamá concuerdan con otros análisis históricos sobre el uso del suelo alrededor de Bahía Culebra. Antes de 1980 se dio un aumento de las prácticas de ganadería extensiva e intensiva, lo que aumentó la tasa de deforestación. Después de 1980 se abandonaron estas prácticas y la cobertura de bosque secundario aumentó hasta el año 2000. Para asegurar una adecuada protección de los manglares, es necesario evaluar también las áreas aledañas y establecer zonas de amortiguamiento alrededor, para reducir los impactos futuros.

Abstract:Despite the economic and environmental services that mangroves provide, they continue to be threatened by overexploitation, pollution, and land use change. Costa Rica has mangrove areas on the Pacific and Caribbean coasts, and cover has been declining since the 1980s. However, data on mangrove coverage are not continually updated and are often based on inaccurate estimates. It is therefore necessary to assess the current extension and variation of the mangrove cover in recent years, to determine changes. The mangrove cover was analyzed in two mangrove forests located in Bahía Culebra, North Pacific: Iguanita and Playa Panamá. For this, aerial photographs and satellite imagery were used to study changes for a 65 year period (1945-2010). Spatio-temporal changes were found in mangrove coverage, adjacent forests and areas without vegetation. Lower mangrove cover occurred during the 1970s (28.4 ha in Iguanita and 4.8 ha in Playa Panamá); but increased in recent years (38.9 ha in Iguanita and 12.0 ha in Panamá). Changes in forest cover by the Iguanita and Playa Panama mangroves were related to the history of land use around Bahía Culebra. Before 1980, there was extensive and intensive cattle ranching, increasing the deforestation rate; after that year, these practices were abandoned and secondary forest coverage increased until 2000. To ensure the adequate protection of mangroves, it is not only important to protect mangrove forests, but it is also necessary to establish buffer zones on their surroundings, to mitigate and/or reduce possible impacts. Rev. Biol. Trop. 64 (3): 955-964. Epub 2016 September 01.

Productividad primaria en el Humedal Nacional Térraba-Sierpe, Costa Rica / Primary productivity in the National Térraba-Sierpe Wetland, Costa Rica

Resumen Se determinó la productividad primaria (PP) del fitoplancton en un amplio sector del Humedal Nacional Térraba Sierpe (HNTS) de Costa Rica, durante la estación lluviosa del año 2008 y en la estación seca del año 2009. Seis sitios se ubicaron en las áreas norte y central del humedal, donde por lo general ocurre la mayor influencia del aporte de caudal del Río Grande de Térraba. Se realizaron adicionalmente determinaciones de otros parámetros ambientales, asociados con la productividad primaria, como profundidad de penetración del disco de Secchi, la concentración de sólidos en suspensión, la concentración de clorofila a, la salinidad, la temperatura, la concentración del oxígeno disuelto en el agua, la concentración de nutrimentos inorgánicos disueltos (amonio, nitrito, fósforo disuelto, silicato), la conductividad eléctrica específica y se llevó a cabo un estudio basado en el análisis de componentes principales. La PP en el HNTS fue en general baja, con un valor máximo de 8.16gC/m2·d de PPN, el cual se registró en la estación seca, en marzo del 2009, en Isla Loros. Los sitios de mayor influencia del río (Samu y El Caite en la estación lluviosa), fueron los que tuvieron valores más bajos, mientras que los sitios con mayor influencia marina fueron los que presentaron los valores más altos de este estudio, cuyo promedio y desviación estándar fue de 0.79±0.50gC/m2.d (n=12), y la mediana fue 0.80gC/m2.d. Esta diferencia se debe principalmente al elevado aporte de agua dulce y de sólidos en suspensión del Río Grande de Térraba que limita el desarrollo del fitoplancton marino en el humedal. Es importante que se establezca y mantenga un programa de monitoreo de los parámetros medidos en este estudio, con al menos dos muestreos por año, uno en la época seca y otro en la época lluviosa, siguiendo el gradiente de salinidad desde el río hasta el mar al menos en dos direcciones.

Abstract Phytoplankton primary production (PP) was determined in a broad sector of the Térraba-Sierpe National Wetland, Costa Rica, from September to November 2008 in the rainy season and from January to March 2009 in the dry season. Six sampling stations were located at the Northern and Central zone of the wetland, according to the main expected flux of Río Grande de Térraba. Additionally other environmental parameters such as Secchi disk depth, suspended solid matter concentration, chlorophyll-a concentration, salinity, temperature, dissolved oxygen concentration, dissolved inorganic nutrients concentrations (phosphate, nitrate, ammonium and silicate), specific conductivity were also measured and a principal components analysis was performed. The PP in the Terraba-Sierpe National Wetland (HNTS by its Spanish name) was generally low, with a maximum value of 8.16gC/m2·d of Net Primary Productivity (NPP), which was recorded in the dry season, in March 2009, at Loros island. Sites that had a greater riverine influence showed lower PP values, while sites with greater marine influence presented higher PP values. These latter had an average and standard deviation of 0.79±0.50gC/m2·d (n=12). This difference is the result of the high input of freshwater and suspended solids from the Río Grande de Térraba which limits the development of marine phytoplankton in the wetland. Rev. Biol. Trop. 63 (Suppl. 1): 9-28. Epub 2015 April 01.