Identification of a new binding site in E. coli FabH using Molecular dynamics simulations: validation by computational alanine mutagenesis and docking studies.

Ramamoorthy, Divya; Turos, Edward; Guida, Wayne C

Ramamoorthy, Divya; Turos, Edward; Guida, Wayne C.

Afiliação

Ramamoorthy D; Department of Chemistry, University of South Florida, Tampa, Florida 33620, United States.

J Chem Inf Model ; 53(5): 1138-56, 2013 May 24.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-23581389

Assuntos

Acetiltransferases/química; Acetiltransferases/metabolismo; Alanina; Proteínas de Escherichia coli/química; Proteínas de Escherichia coli/metabolismo; Escherichia coli/enzimologia; Simulação de Acoplamento Molecular; Simulação de Dinâmica Molecular; Mutagênese; 3-Oxoacil-(Proteína de Transporte de Acila) Sintase; Acetiltransferases/antagonistas & inibidores; Acetiltransferases/genética; Sítios de Ligação; Domínio Catalítico; Análise por Conglomerados; Avaliação Pré-Clínica de Medicamentos; Inibidores Enzimáticos/metabolismo; Inibidores Enzimáticos/farmacologia; Proteínas de Escherichia coli/antagonistas & inibidores; Proteínas de Escherichia coli/genética; Ácido Graxo Sintase Tipo II/antagonistas & inibidores; Ácido Graxo Sintase Tipo II/química; Ácido Graxo Sintase Tipo II/genética; Ácido Graxo Sintase Tipo II/metabolismo; Humanos; Interações Hidrofóbicas e Hidrofílicas; Reprodutibilidade dos Testes; Solventes/química; Interface Usuário-Computador

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Texto completo: 1 Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Acetiltransferases / Mutagênese / Proteínas de Escherichia coli / Alanina / Escherichia coli / Simulação de Dinâmica Molecular / Simulação de Acoplamento Molecular Idioma: En Ano de publicação: 2013 Tipo de documento: Article

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