Splicing changes in SMA mouse motoneurons and SMN-depleted neuroblastoma cells: evidence for involvement of splicing regulatory proteins.

Huo, Qing; Kayikci, Melis; Odermatt, Philipp; Meyer, Kathrin; Michels, Olivia; Saxena, Smita; Ule, Jernej; Schümperli, Daniel

Huo, Qing; Kayikci, Melis; Odermatt, Philipp; Meyer, Kathrin; Michels, Olivia; Saxena, Smita; Ule, Jernej; Schümperli, Daniel.

Afiliação

Huo Q; a Institute of Cell Biology ; University of Bern ; Bern , Switzerland.

RNA Biol ; 11(11): 1430-46, 2014.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-25692239

Assuntos

Regulação da Expressão Gênica; Neurônios Motores/metabolismo; Splicing de RNA; Proteínas do Complexo SMN/genética; Animais; Western Blotting; Linhagem Celular Tumoral; Células Cultivadas; Humanos; Íntrons/genética; Proteínas de Membrana/genética; Proteínas de Membrana/metabolismo; Camundongos; Camundongos Knockout; Camundongos Transgênicos; Atrofia Muscular Espinal/genética; Atrofia Muscular Espinal/metabolismo; Atrofia Muscular Espinal/patologia; Neuroblastoma/genética; Neuroblastoma/metabolismo; Neuroblastoma/patologia; Interferência de RNA; Fatores de Processamento de RNA; Proteínas de Ligação a RNA/genética; Proteínas de Ligação a RNA/metabolismo; Reação em Cadeia da Polimerase Via Transcriptase Reversa; Proteínas do Complexo SMN/metabolismo; Septinas/genética; Septinas/metabolismo

Palavras-chave

ESE, exonic splicing enhancer; FCS, fetal calf serum; MN, motoneuron; NMD, nonsense-mediated mRNA decay; NMJ, neuromuscular junction, PCR; RT, reverse transcription; SMA, Spinal Muscular Atrophy; SMN, Survival Motor Neuron; Spinal Muscular Atrophy; TcRß, T-cell receptor ß chain; exon junction microarray; hz, heterozygote, LCM; laser capture microdissection; major spliceosome; minor spliceosome; motoneurons; neurodegerative disease; polymerase chain reaction, qPCR; real-time (quantitative) PCR; sh, short hairpin; snRNA, small nuclear ribonucleic acid; snRNP assembly; snRNP, small nuclear ribonucleoprotein; splicing; splicing regulators

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Texto completo: 1 Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Splicing de RNA / Regulação da Expressão Gênica / Proteínas do Complexo SMN / Neurônios Motores Idioma: En Ano de publicação: 2014 Tipo de documento: Article

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