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An investigation of causes of false positive single nucleotide polymorphisms using simulated reads from a small eukaryote genome.
Ribeiro, Antonio; Golicz, Agnieszka; Hackett, Christine Anne; Milne, Iain; Stephen, Gordon; Marshall, David; Flavell, Andrew J; Bayer, Micha.
Afiliação
  • Ribeiro A; The James Hutton Institute, Invergowrie, Dundee, DD2 5DA, Scotland, UK. antonio.ribeiro@hutton.ac.uk.
  • Golicz A; Division of Plant Sciences, University of Dundee at JHI, Invergowrie, Dundee, DD2 5DA, Scotland, UK. antonio.ribeiro@hutton.ac.uk.
  • Hackett CA; School of Agriculture and Food Sciences, University of Queensland, Brisbane, Queensland, 4072, Australia. agnieszka.golicz@uq.net.au.
  • Milne I; Australian Centre for Plant Functional Genomics and School of Agriculture and Food Sciences, University of Queensland, Brisbane, Queensland, 4072, Australia. agnieszka.golicz@uq.net.au.
  • Stephen G; Biomathematics and Statistics Scotland, Invergowrie, Dundee, DD2 5DA, Scotland, UK. Christine.Hackett@bioss.ac.uk.
  • Marshall D; The James Hutton Institute, Invergowrie, Dundee, DD2 5DA, Scotland, UK. iain.milne@hutton.ac.uk.
  • Flavell AJ; The James Hutton Institute, Invergowrie, Dundee, DD2 5DA, Scotland, UK. gordon.stephen@hutton.ac.uk.
  • Bayer M; The James Hutton Institute, Invergowrie, Dundee, DD2 5DA, Scotland, UK. david.marshall@hutton.ac.uk.
BMC Bioinformatics ; 16: 382, 2015 Nov 11.
Article em En | MEDLINE | ID: mdl-26558718
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Texto completo: 1 Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Software / Análise de Sequência de DNA / Polimorfismo de Nucleotídeo Único / Eucariotos / Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala / Anotação de Sequência Molecular Idioma: En Ano de publicação: 2015 Tipo de documento: Article
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