Targeted gene enrichment and high-throughput sequencing for environmental biomonitoring: a case study using freshwater macroinvertebrates.

Dowle, Eddy J; Pochon, Xavier; C Banks, Jonathan; Shearer, Karen; Wood, Susanna A

Dowle, Eddy J; Pochon, Xavier; C Banks, Jonathan; Shearer, Karen; Wood, Susanna A.

Afiliação

Dowle EJ; Cawthron Institute, 98 Halifax Street, 7010, Nelson, New Zealand.
Pochon X; Department of Entomology, Kansas State University, Waters Hall, Manhattan, KS, 66502, USA.
C Banks J; Cawthron Institute, 98 Halifax Street, 7010, Nelson, New Zealand.
Shearer K; Institute of Marine Science, University of Auckland, PO Box 349, Warkworth 0941, New Zealand.
Wood SA; Cawthron Institute, 98 Halifax Street, 7010, Nelson, New Zealand.

Mol Ecol Resour ; 16(5): 1240-54, 2016 Sep.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-26583904

Assuntos

Monitoramento Ambiental/métodos; Água Doce/parasitologia; Invertebrados/classificação; Invertebrados/genética; Metagenômica/métodos; Animais; DNA/genética; DNA/isolamento & purificação; Código de Barras de DNA Taxonômico/métodos; Erros de Diagnóstico; Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala/métodos; Nova Zelândia; Reação em Cadeia da Polimerase/métodos; Rios/parasitologia

Palavras-chave

biomonitoring; gene enrichment; high-throughput sequencing; macroinvertebrates; metabarcoding

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Texto completo: 1 Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Monitoramento Ambiental / Metagenômica / Água Doce / Invertebrados Idioma: En Ano de publicação: 2016 Tipo de documento: Article

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