Effect of sample pooling and transport conditions on the clinical sensitivity of a real-time polymerase chain reaction assay for Campylobacter fetus subsp. venerealis in preputial samples from bulls.

Le diagnostic de la campylobactériose génitale bovine (CGB) présente des défis significatifs, étant donné que les méthodes traditionnelles manquent de sensibilité lorsqu'un transport prolongé des échantillons est requis. Les épreuves utilisant des échantillons prépuciaux dans des épreuves de réaction d'amplification en chaine par la polymérase en temps réel (PCR) ont une bonne sensibilité et une capacité de rendement élevée. Toutefois, il y a peu d'information sur la durée acceptable du transport et de la température durant le transport des échantillons. De plus, l'utilisation d'échantillons regroupés s'est avéré être une stratégie valable pour le diagnostic d'autres maladies vénériennes chez les bovins. Les objectifs de la présente étude étaient de déterminer l'effet du regroupement d'échantillons et du temps de transport et de la température sur la sensibilité clinique d'une épreuve PCR quantitative en temps réel (qPCR) pour Campylobacter fetus ssp. venerealis dans des échantillons prépuciaux provenant de taureaux. Huit taureaux infectés et 176 bouvillons vierges ont été utilisés comme source des échantillons. La sensibilité du qPCR était comparable pour des échantillons non-regroupés et des regroupements de 5 échantillons, mais diminuée pour des regroupements de 10 échantillons. La sensibilité pour les différentes tailles de regroupement s'améliorait suite à des échantillonnages répétés. Pour des transport de courte durée (2 et 48 h), la sensibilité était plus élevée lorsque les échantillons étaient entreposés à 4 °C et 30 °C, alors que pour le transport de longue durée (96 h) la sensibilité était plus élevée lorsque les échantillons étaient entreposés à −20 °C. La création de regroupement de 5 échantillons est une bonne option pour diminuer les coûts lors du tamisage de taureaux pour CGB avec le qPCR effectué directement sur des échantillons prépuciaux. Idéalement, les échantillons devraient être entreposés à 4 °C et arriver au laboratoire au plus tard 48 h après le prélèvement, si ce n'est pas possible, la congélation à −20 °C pourrait minimiser la perte de sensibilité.(Traduit par Docteur Serge Messier).