Don't put all your eggs in one basket: a cost-effective and powerful method to optimize primer choice for rRNA environmental community analyses using the Fluidigm Access Array.

Brown, Shawn P; Ferrer, Astrid; Dalling, James W; Heath, Katy D

Brown, Shawn P; Ferrer, Astrid; Dalling, James W; Heath, Katy D.

Afiliação

Brown SP; Department of Plant Biology, University of Illinois at Urbana-Champaign, 505 S Goodwin Ave., Urbana, IL, 61801, USA.
Ferrer A; Department of Plant Biology, University of Illinois at Urbana-Champaign, 505 S Goodwin Ave., Urbana, IL, 61801, USA.
Dalling JW; Department of Plant Biology, University of Illinois at Urbana-Champaign, 505 S Goodwin Ave., Urbana, IL, 61801, USA.
Heath KD; Smithsonian Tropical Research Institute, Apartado 0843-03092, Balboa, Ancon, Panama.

Mol Ecol Resour ; 16(4): 946-56, 2016 Jul.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-26849494

Assuntos

Primers do DNA/genética; Microbiologia Ambiental; Metagenômica/métodos; RNA Ribossômico/genética; Análise de Sequência de DNA/métodos; Análise Custo-Benefício; Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala/métodos; Sensibilidade e Especificidade

Palavras-chave

Fluidigm; fungi; internal transcribed spacer; large subunit; mock community; primer selection

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Texto completo: 1 Base de dados: MEDLINE Assunto principal: RNA Ribossômico / Análise de Sequência de DNA / Primers do DNA / Microbiologia Ambiental / Metagenômica Idioma: En Ano de publicação: 2016 Tipo de documento: Article

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