Improvements to the HITS-CLIP protocol eliminate widespread mispriming artifacts.

Gillen, Austin E; Yamamoto, Tomomi M; Kline, Enos; Hesselberth, Jay R; Kabos, Peter

Gillen, Austin E; Yamamoto, Tomomi M; Kline, Enos; Hesselberth, Jay R; Kabos, Peter.

Afiliação

Gillen AE; Department of Medicine, University of Colorado Denver, Aurora, CO, USA. austin.gillen@ucdenver.edu.
Yamamoto TM; Department of Medicine, University of Colorado Denver, Aurora, CO, USA.
Kline E; Department of Medicine, University of Colorado Denver, Aurora, CO, USA.
Hesselberth JR; Present Address: Department of Bioengineering, University of Washington, Seattle, WA, USA.
Kabos P; Department of Biochemistry and Molecular Genetics, University of Colorado Denver, Aurora, CO, USA.

BMC Genomics ; 17: 338, 2016 05 05.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-27150721

Assuntos

Artefatos; Sítios de Ligação; Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala; Imunoprecipitação; Proteínas de Ligação a RNA/metabolismo; RNA/genética; RNA/metabolismo; Primers do DNA; Expressão Gênica; Biblioteca Gênica; Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala/métodos; Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala/normas; Imunoprecipitação/métodos; MicroRNAs/química; MicroRNAs/genética; MicroRNAs/metabolismo; Ligação Proteica; RNA/química; Reação em Cadeia da Polimerase Via Transcriptase Reversa/normas; Sensibilidade e Especificidade; Análise de Sequência de RNA

Palavras-chave

CLIP-seq; HITS-CLIP; PAR-CLIP; iCLIP; microRNA

Texto completo

Imprimir

XML

PubMed Links

Buscar no Google

Texto completo: 1 Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Sítios de Ligação / RNA / Proteínas de Ligação a RNA / Artefatos / Imunoprecipitação / Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala Idioma: En Ano de publicação: 2016 Tipo de documento: Article

Texto completo

Imprimir

XML

PubMed Links

Buscar no Google