Analysis of large 16S rRNA Illumina data sets: Impact of singleton read filtering on microbial community description.

Auer, Lucas; Mariadassou, Mahendra; O'Donohue, Michael; Klopp, Christophe; Hernandez-Raquet, Guillermina

Auer, Lucas; Mariadassou, Mahendra; O'Donohue, Michael; Klopp, Christophe; Hernandez-Raquet, Guillermina.

Afiliação

Auer L; INSA, UPS, LISBP, Université de Toulouse, Toulouse Cedex 4, France.
Mariadassou M; INRA, UMR792 Ingénierie des Systèmes Biologiques et des Procédés, Toulouse, France.
O'Donohue M; CNRS, UMR5504, Toulouse, France.
Klopp C; MaIAGE, INRA, Université Paris-Saclay, Jouy-en-Josas, France.
Hernandez-Raquet G; INSA, UPS, LISBP, Université de Toulouse, Toulouse Cedex 4, France.

Mol Ecol Resour ; 17(6): e122-e132, 2017 Nov.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-28695665

Assuntos

Biologia Computacional/métodos; Metagenômica/métodos; Microbiota; Filogenia; Análise por Conglomerados; DNA Ribossômico/química; DNA Ribossômico/genética; RNA Ribossômico 16S/genética; Análise de Sequência de DNA

Palavras-chave

16SrRNA; Illumina; metabarcoding; microbial diversity; singleton filtering

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Texto completo: 1 Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Filogenia / Biologia Computacional / Metagenômica / Microbiota Idioma: En Ano de publicação: 2017 Tipo de documento: Article

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