The three-dimensional genome organization of Drosophila melanogaster through data integration.

Li, Qingjiao; Tjong, Harianto; Li, Xiao; Gong, Ke; Zhou, Xianghong Jasmine; Chiolo, Irene; Alber, Frank

Li, Qingjiao; Tjong, Harianto; Li, Xiao; Gong, Ke; Zhou, Xianghong Jasmine; Chiolo, Irene; Alber, Frank.

Afiliação

Li Q; Molecular and Computational Biology, Department of Biological Sciences, University of Southern California, 1050 Childs Way, Los Angeles, CA, 90089, USA.
Tjong H; Molecular and Computational Biology, Department of Biological Sciences, University of Southern California, 1050 Childs Way, Los Angeles, CA, 90089, USA.
Li X; Molecular and Computational Biology, Department of Biological Sciences, University of Southern California, 1050 Childs Way, Los Angeles, CA, 90089, USA.
Gong K; Molecular and Computational Biology, Department of Biological Sciences, University of Southern California, 1050 Childs Way, Los Angeles, CA, 90089, USA.
Zhou XJ; Department of Pathology and Laboratory Medicine, David Geffen School of Medicine, University of California, Los Angeles, USA.
Chiolo I; Molecular and Computational Biology, Department of Biological Sciences, University of Southern California, 1050 Childs Way, Los Angeles, CA, 90089, USA. chiolo@usc.edu.
Alber F; Molecular and Computational Biology, Department of Biological Sciences, University of Southern California, 1050 Childs Way, Los Angeles, CA, 90089, USA. alber@usc.edu.

Genome Biol ; 18(1): 145, 2017 07 31.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-28760140

Assuntos

Cromossomos de Insetos/ultraestrutura; Mineração de Dados/estatística & dados numéricos; Drosophila melanogaster/genética; Regulação da Expressão Gênica no Desenvolvimento; Genoma de Inseto; Heterocromatina/ultraestrutura; Animais; Núcleo Celular/química; Núcleo Celular/ultraestrutura; Proteínas Cromossômicas não Histona/genética; Proteínas Cromossômicas não Histona/metabolismo; Mapeamento Cromossômico/métodos; Cromossomos de Insetos/química; Proteínas de Drosophila/genética; Proteínas de Drosophila/metabolismo; Drosophila melanogaster/crescimento & desenvolvimento; Embrião não Mamífero; Heterogeneidade Genética; Heterocromatina/química; Hibridização in Situ Fluorescente; Família Multigênica; Proteínas Nucleares/genética; Proteínas Nucleares/metabolismo; Fatores de Transcrição/genética; Fatores de Transcrição/metabolismo; Transcrição Gênica

Palavras-chave

3D genome structure; Data integration; Drosophila melanogaster; Heterochromatin; Hi-C; Higher order genome organization; Homologous pairing; Lamina-DamID; Population-based modeling

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Texto completo: 1 Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Heterocromatina / Regulação da Expressão Gênica no Desenvolvimento / Drosophila melanogaster / Genoma de Inseto / Mineração de Dados / Cromossomos de Insetos Idioma: En Ano de publicação: 2017 Tipo de documento: Article

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