RNA folding kinetics using Monte Carlo and Gillespie algorithms.

Clote, Peter; Bayegan, Amir H

Clote, Peter; Bayegan, Amir H.

Afiliação

Clote P; Department of Biology, Boston College, Chestnut Hill, MA, 02467, USA. clote@bc.edu.
Bayegan AH; Department of Biology, Boston College, Chestnut Hill, MA, 02467, USA.

J Math Biol ; 76(5): 1195-1227, 2018 04.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-28780735

Assuntos

Algoritmos; Modelos Moleculares; Dobramento de RNA; Sequência de Bases; Cinética; Cadeias de Markov; Conceitos Matemáticos; Método de Monte Carlo; RNA/química

Palavras-chave

Expected network degree; Gillespie algorithm mean recurrence time; Mean first passage time; Metropolis algorithm; RNA secondary structure; Refolding kinetics

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Texto completo: 1 Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Algoritmos / Modelos Moleculares / Dobramento de RNA Idioma: En Ano de publicação: 2018 Tipo de documento: Article

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