C-State: an interactive web app for simultaneous multi-gene visualization and comparative epigenetic pattern search.

Sowpati, Divya Tej; Srivastava, Surabhi; Dhawan, Jyotsna; Mishra, Rakesh K

Sowpati, Divya Tej; Srivastava, Surabhi; Dhawan, Jyotsna; Mishra, Rakesh K.

Afiliação

Sowpati DT; CSIR- Centre for Cellular and Molecular Biology, Hyderabad, India.
Srivastava S; CSIR- Centre for Cellular and Molecular Biology, Hyderabad, India. ssurabhi@ccmb.res.in.
Dhawan J; CSIR- Centre for Cellular and Molecular Biology, Hyderabad, India.
Mishra RK; CSIR- Centre for Cellular and Molecular Biology, Hyderabad, India. mishra@ccmb.res.in.

BMC Bioinformatics ; 18(Suppl 10): 392, 2017 Sep 13.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-28929968

Assuntos

Epigenômica; Genes; Software; Navegador; Algoritmos; Células-Tronco Embrionárias/metabolismo; Genômica; Células HeLa; Humanos; Internet; Células K562; Regiões Promotoras Genéticas/genética; Transcrição Gênica

Palavras-chave

ChIP-seq; Chromatin state; Epigenetic patterns; Genome browser; JavaScript; RNA-seq; Visualization; Web app

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Texto completo: 1 Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Software / Epigenômica / Navegador / Genes Idioma: En Ano de publicação: 2017 Tipo de documento: Article

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