Synthetic enhancer design by in silico compensatory evolution reveals flexibility and constraint in cis-regulation.

Barr, Kenneth A; Martinez, Carlos; Moran, Jennifer R; Kim, Ah-Ram; Ramos, Alexandre F; Reinitz, John

Barr, Kenneth A; Martinez, Carlos; Moran, Jennifer R; Kim, Ah-Ram; Ramos, Alexandre F; Reinitz, John.

Afiliação

Barr KA; Committee on Genetics, Genomics, and Systems Biology, University of Chicago, Zoology 111, 1101 E 57th St, Chicago, 60637, Illinois, USA. kenneth.a.barr@gmail.com.
Martinez C; Department of Ecology and Evolution, The University of Chicago, Chicago, 60637, Illinois, USA. kenneth.a.barr@gmail.com.
Moran JR; Department Biochemistry and Molecular Genetics, Northwestern University, Chicago, 60611, Illinois, USA.
Kim AR; Department Human Genetics, The University of Chicago, Chicago, 60637, Illinois, USA.
Ramos AF; Institute for Genomics & Systems Biology, The University of Chicago, Chicago, 60637, Illinois, USA.
Reinitz J; School of Life Science, Handong Global University, Pohang, 37554, Gyeongbuk, South Korea.

BMC Syst Biol ; 11(1): 116, 2017 Nov 29.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-29187214

Assuntos

Drosophila melanogaster/genética; Elementos Facilitadores Genéticos; Evolução Molecular; Regulação da Expressão Gênica no Desenvolvimento; Animais; Sítios de Ligação; Simulação por Computador; Proteínas de Ligação a DNA/genética; Proteínas de Ligação a DNA/metabolismo; Proteínas de Drosophila/genética; Proteínas de Drosophila/metabolismo; Drosophila melanogaster/crescimento & desenvolvimento; Embrião não Mamífero/citologia; Embrião não Mamífero/metabolismo; Proteínas de Homeodomínio/genética; Proteínas de Homeodomínio/metabolismo; Proteínas Nucleares; Fatores de Transcrição STAT/genética; Fatores de Transcrição STAT/metabolismo; Transativadores/genética; Transativadores/metabolismo; Fatores de Transcrição/genética; Fatores de Transcrição/metabolismo

Palavras-chave

Bicoid; Cis-regulatory logic; Dicheate; Even-skipped regulation; Gene regulatory models; Hunchback; Stat92E; Synthetic enhancers; Transriptional control; Zelda

Texto completo

Imprimir

XML

PubMed Links

Buscar no Google

Texto completo: 1 Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Elementos Facilitadores Genéticos / Regulação da Expressão Gênica no Desenvolvimento / Evolução Molecular / Drosophila melanogaster Idioma: En Ano de publicação: 2017 Tipo de documento: Article

Texto completo

Imprimir

XML

PubMed Links

Buscar no Google