HOME: a histogram based machine learning approach for effective identification of differentially methylated regions.

Srivastava, Akanksha; Karpievitch, Yuliya V; Eichten, Steven R; Borevitz, Justin O; Lister, Ryan

Srivastava, Akanksha; Karpievitch, Yuliya V; Eichten, Steven R; Borevitz, Justin O; Lister, Ryan.

Afiliação

Srivastava A; ARC Centre of Excellence in Plant Energy Biology, The University of Western Australia, Perth, Australia.
Karpievitch YV; ARC Centre of Excellence in Plant Energy Biology, The University of Western Australia, Perth, Australia.
Eichten SR; Harry Perkins Institute of Medical Research, Perth, Australia.
Borevitz JO; ARC Centre of Excellence in Plant Energy Biology, The Australian National University, Canberra, Australia.
Lister R; ARC Centre of Excellence in Plant Energy Biology, The Australian National University, Canberra, Australia.

BMC Bioinformatics ; 20(1): 253, 2019 May 16.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-31096906

Assuntos

Algoritmos; Metilação de DNA/genética; Aprendizado de Máquina; Animais; Simulação por Computador; Bases de Dados Genéticas; Camundongos; Anotação de Sequência Molecular; Fatores de Tempo

Palavras-chave

DMR identification; DNA methylation; Epigenetics; SVM; Whole genome bisulfite sequencing

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Texto completo: 1 Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Algoritmos / Metilação de DNA / Aprendizado de Máquina Idioma: En Ano de publicação: 2019 Tipo de documento: Article

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