Automated Curation of CNMF-E-Extracted ROI Spatial Footprints and Calcium Traces Using Open-Source AutoML Tools.

Tran, Lina M; Mocle, Andrew J; Ramsaran, Adam I; Jacob, Alexander D; Frankland, Paul W; Josselyn, Sheena A

Tran, Lina M; Mocle, Andrew J; Ramsaran, Adam I; Jacob, Alexander D; Frankland, Paul W; Josselyn, Sheena A.

Afiliação

Tran LM; Hospital for Sick Children, Neurosciences and Mental Health, Toronto, ON, Canada.
Mocle AJ; Department of Physiology, University of Toronto, Toronto, ON, Canada.
Ramsaran AI; Postgraduate Affiliates Program, Vector Institute, Toronto, ON, Canada.
Jacob AD; Hospital for Sick Children, Neurosciences and Mental Health, Toronto, ON, Canada.
Frankland PW; Department of Physiology, University of Toronto, Toronto, ON, Canada.
Josselyn SA; Hospital for Sick Children, Neurosciences and Mental Health, Toronto, ON, Canada.

Front Neural Circuits ; 14: 42, 2020.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-32792911

Assuntos

Cálcio/metabolismo; Processamento de Imagem Assistida por Computador/métodos; Aprendizado de Máquina; Microscopia de Fluorescência; Neurônios/metabolismo; Neurônios/patologia; Imagem Óptica; Automação; Humanos

Palavras-chave

1-photon; CNMF-E; calcium imaging; machine learning; microendoscopy; open-source

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Texto completo: 1 Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Processamento de Imagem Assistida por Computador / Cálcio / Imagem Óptica / Aprendizado de Máquina / Microscopia de Fluorescência / Neurônios Idioma: En Ano de publicação: 2020 Tipo de documento: Article

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