Ensemble-based enzyme design can recapitulate the effects of laboratory directed evolution in silico.

Broom, Aron; Rakotoharisoa, Rojo V; Thompson, Michael C; Zarifi, Niayesh; Nguyen, Erin; Mukhametzhanov, Nurzhan; Liu, Lin; Fraser, James S; Chica, Roberto A

Broom, Aron; Rakotoharisoa, Rojo V; Thompson, Michael C; Zarifi, Niayesh; Nguyen, Erin; Mukhametzhanov, Nurzhan; Liu, Lin; Fraser, James S; Chica, Roberto A.

Afiliação

Broom A; Department of Chemistry and Biomolecular Sciences, University of Ottawa, 10 Marie Curie, Ottawa, ON, K1N 6N5, Canada.
Rakotoharisoa RV; Department of Chemistry and Biomolecular Sciences, University of Ottawa, 10 Marie Curie, Ottawa, ON, K1N 6N5, Canada.
Thompson MC; Department of Bioengineering and Therapeutic Science, University of California, San Francisco, San Francisco, CA, 94158, USA.
Zarifi N; Department of Chemistry and Chemical Biology, University of California, Merced, Merced, CA, 95343, USA.
Nguyen E; Department of Chemistry and Biomolecular Sciences, University of Ottawa, 10 Marie Curie, Ottawa, ON, K1N 6N5, Canada.
Mukhametzhanov N; Department of Chemistry and Biomolecular Sciences, University of Ottawa, 10 Marie Curie, Ottawa, ON, K1N 6N5, Canada.
Liu L; Department of Chemistry and Biomolecular Sciences, University of Ottawa, 10 Marie Curie, Ottawa, ON, K1N 6N5, Canada.
Fraser JS; Department of Bioengineering and Therapeutic Science, University of California, San Francisco, San Francisco, CA, 94158, USA.
Chica RA; Department of Bioengineering and Therapeutic Science, University of California, San Francisco, San Francisco, CA, 94158, USA.

Nat Commun ; 11(1): 4808, 2020 09 23.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-32968058

Assuntos

Simulação por Computador; Evolução Molecular Direcionada/métodos; Enzimas/química; Evolução Química; Liases/química; Catálise; Domínio Catalítico; Cristalografia por Raios X; Estabilidade Enzimática; Enzimas/genética; Enzimas/metabolismo; Cinética; Liases/genética; Liases/metabolismo; Simulação de Dinâmica Molecular; Mutação; Conformação Proteica; Engenharia de Proteínas

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Texto completo: 1 Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Simulação por Computador / Evolução Molecular Direcionada / Evolução Química / Enzimas / Liases Idioma: En Ano de publicação: 2020 Tipo de documento: Article

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