Improving CLIP-seq data analysis by incorporating transcript information.

Uhl, Michael; Tran, Van Dinh; Backofen, Rolf

Uhl, Michael; Tran, Van Dinh; Backofen, Rolf.

Afiliação

Uhl M; Bioinformatics Group, Department of Computer Science, University of Freiburg, Georges-Köhler-Allee 106, Freiburg, 79110, Germany.
Tran VD; Bioinformatics Group, Department of Computer Science, University of Freiburg, Georges-Köhler-Allee 106, Freiburg, 79110, Germany.
Backofen R; Bioinformatics Group, Department of Computer Science, University of Freiburg, Georges-Köhler-Allee 106, Freiburg, 79110, Germany. backofen@informatik.uni-freiburg.de.

BMC Genomics ; 21(1): 894, 2020 Dec 17.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-33334306

Assuntos

Sequenciamento de Cromatina por Imunoprecipitação; Análise de Dados; Sítios de Ligação; Genoma; Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala; Proteínas de Ligação a RNA/genética; Proteínas de Ligação a RNA/metabolismo; Análise de Sequência de RNA

Palavras-chave

CLIP-seq; Peak calling; RBP binding site prediction; eCLIP

Texto completo

Imprimir

XML

PubMed Links

Buscar no Google

Texto completo: 1 Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Análise de Dados / Sequenciamento de Cromatina por Imunoprecipitação Idioma: En Ano de publicação: 2020 Tipo de documento: Article

Texto completo

Imprimir

XML

PubMed Links

Buscar no Google