scSNV: accurate dscRNA-seq SNV co-expression analysis using duplicate tag collapsing.

Wilson, Gavin W; Derouet, Mathieu; Darling, Gail E; Yeung, Jonathan C

Wilson, Gavin W; Derouet, Mathieu; Darling, Gail E; Yeung, Jonathan C.

Afiliação

Wilson GW; Latner Thoracic Surgery Research Laboratories, University Health Network, 101 College St., 2-501, Toronto, ON, M5G 2C4, Canada. gavin.wilson@uhnresearch.ca.
Derouet M; Latner Thoracic Surgery Research Laboratories, University Health Network, 101 College St., 2-501, Toronto, ON, M5G 2C4, Canada.
Darling GE; Latner Thoracic Surgery Research Laboratories, University Health Network, 101 College St., 2-501, Toronto, ON, M5G 2C4, Canada.
Yeung JC; Division of Thoracic Surgery, Department of Surgery, University of Toronto, Toronto, M5G 2C4, Canada.

Genome Biol ; 22(1): 144, 2021 05 07.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-33962667

Assuntos

Polimorfismo de Nucleotídeo Único/genética; Software; Algoritmos; Alelos; Simulação por Computador; Humanos; Reação em Cadeia da Polimerase; RNA Mensageiro/genética; RNA Mensageiro/metabolismo; RNA-Seq; Análise de Célula Única; Sequenciamento Completo do Genoma

Palavras-chave

Alignment; Genetic variation; Single-cell RNA-seq; Variant calling

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Texto completo: 1 Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Software / Polimorfismo de Nucleotídeo Único Idioma: En Ano de publicação: 2021 Tipo de documento: Article

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