RoboCOP: jointly computing chromatin occupancy profiles for numerous factors from chromatin accessibility data.

Mitra, Sneha; Zhong, Jianling; Tran, Trung Q; MacAlpine, David M; Hartemink, Alexander J

Mitra, Sneha; Zhong, Jianling; Tran, Trung Q; MacAlpine, David M; Hartemink, Alexander J.

Afiliação

Mitra S; Department of Computer Science, Duke University, Durham, NC 27708, USA.
Zhong J; Program in Computational Biology and Bioinformatics, Duke University, Durham, NC 27708, USA.
Tran TQ; Department of Computer Science, Duke University, Durham, NC 27708, USA.
MacAlpine DM; Program in Computational Biology and Bioinformatics, Duke University, Durham, NC 27708, USA.
Hartemink AJ; Department of Pharmacology and Cancer Biology, Duke University Medical Center, Durham, NC 27710, USA.

Nucleic Acids Res ; 49(14): 7925-7938, 2021 08 20.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-34255854

Assuntos

Algoritmos; Sequenciamento de Cromatina por Imunoprecipitação/métodos; Cromatina/genética; Biologia Computacional/métodos; Genoma Fúngico/genética; Saccharomyces cerevisiae/genética; Cromatina/metabolismo; Regulação Fúngica da Expressão Gênica; Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala/métodos; Mutação; Nucleossomos/genética; Nucleossomos/metabolismo; RNA-Seq/métodos; Fatores de Transcrição/genética; Fatores de Transcrição/metabolismo

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Texto completo: 1 Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Saccharomyces cerevisiae / Algoritmos / Cromatina / Genoma Fúngico / Biologia Computacional / Sequenciamento de Cromatina por Imunoprecipitação Idioma: En Ano de publicação: 2021 Tipo de documento: Article

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