In-silico screening and microsecond molecular dynamics simulations to identify single point mutations that destabilize ß-hexosaminidase A causing Tay-Sachs disease.

Almanasra, Ahmad; Havranek, Brandon; Islam, Shahidul M

Almanasra, Ahmad; Havranek, Brandon; Islam, Shahidul M.

Afiliação

Almanasra A; Department of Chemistry, University of Illinois at Chicago, Chicago, Illinois, USA.
Havranek B; Department of Chemistry, University of Illinois at Chicago, Chicago, Illinois, USA.
Islam SM; Department of Chemistry, University of Illinois at Chicago, Chicago, Illinois, USA.

Proteins ; 89(11): 1587-1601, 2021 11.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-34288098

Assuntos

Gangliosídeo G(M2)/química; Simulação de Dinâmica Molecular; Mutação Puntual; Polimorfismo de Nucleotídeo Único; Doença de Tay-Sachs/genética; Cadeia alfa da beta-Hexosaminidase/química; Acetilglucosamina/análogos & derivados; Acetilglucosamina/química; Acetilglucosamina/farmacologia; Sítios de Ligação; Sistema Nervoso Central/enzimologia; Sistema Nervoso Central/patologia; Gangliosídeo G(M2)/metabolismo; Expressão Gênica; Humanos; Ligação de Hidrogênio; Neurônios/enzimologia; Neurônios/patologia; Sistema Nervoso Periférico/enzimologia; Sistema Nervoso Periférico/patologia; Ligação Proteica; Conformação Proteica em alfa-Hélice; Conformação Proteica em Folha beta; Domínios e Motivos de Interação entre Proteínas; Doença de Tay-Sachs/enzimologia; Doença de Tay-Sachs/patologia; Termodinâmica; Tiazóis/química; Tiazóis/farmacologia; Cadeia alfa da beta-Hexosaminidase/genética; Cadeia alfa da beta-Hexosaminidase/metabolismo

Palavras-chave

MM/GBSA; MutPred; NAG-thiazoline (NGT); PhD-SNP; PolyPhen-2; SIFT; Tay-Sachs disease (TSD); binding affinity; hydrogen bonding; molecular dynamic simulation; nonsynonymous single nucleotide polymorphism (nsSNP); ß-hexosaminidase A (HexA)

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Texto completo: 1 Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Doença de Tay-Sachs / Mutação Puntual / Polimorfismo de Nucleotídeo Único / Cadeia alfa da beta-Hexosaminidase / Simulação de Dinâmica Molecular / Gangliosídeo G(M2) Idioma: En Ano de publicação: 2021 Tipo de documento: Article

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