Prediction of RBP binding sites on circRNAs using an LSTM-based deep sequence learning architecture.

Wang, Zhengfeng; Lei, Xiujuan

Wang, Zhengfeng; Lei, Xiujuan.

Afiliação

Wang Z; School of Computer Science, Shaanxi Normal University, Xi'an, China.
Lei X; College of Information Science and Engineering, Guilin University of Technology, Guilin, China.

Brief Bioinform ; 22(6)2021 11 05.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-34415289

Assuntos

Sequência de Bases; Sítios de Ligação; Biologia Computacional/métodos; Aprendizado Profundo; RNA Circular/química; Proteínas de Ligação a RNA/química; Algoritmos; Bases de Dados Genéticas; RNA Circular/metabolismo; Proteínas de Ligação a RNA/metabolismo; Curva ROC; Reprodutibilidade dos Testes

Palavras-chave

RNA-binding protein; binding sites; circular RNA; long short-term memory

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Texto completo: 1 Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Sítios de Ligação / Sequência de Bases / Proteínas de Ligação a RNA / Biologia Computacional / Aprendizado Profundo / RNA Circular Idioma: En Ano de publicação: 2021 Tipo de documento: Article

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