DEGnext: classification of differentially expressed genes from RNA-seq data using a convolutional neural network with transfer learning.

Kakati, Tulika; Bhattacharyya, Dhruba K; Kalita, Jugal K; Norden-Krichmar, Trina M

Kakati, Tulika; Bhattacharyya, Dhruba K; Kalita, Jugal K; Norden-Krichmar, Trina M.

Afiliação

Kakati T; Department of Epidemiology and Biostatistics, University of California, Irvine, Irvine, CA, USA.
Bhattacharyya DK; Department of Computer Science, Tezpur University, Assam, India.
Kalita JK; Department of Computer Science, Tezpur University, Assam, India.
Norden-Krichmar TM; Department of Computer Science, University of Colorado, Colorado Springs, Colorado Springs, CO, USA.

BMC Bioinformatics ; 23(1): 17, 2022 Jan 06.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-34991439

Assuntos

Neoplasias; Redes Neurais de Computação; Humanos; Aprendizado de Máquina; RNA-Seq; Máquina de Vetores de Suporte

Palavras-chave

Classification; Convolutional neural network; Differentially expressed genes; Disease biomarkers; Transfer learning

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Texto completo: 1 Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Redes Neurais de Computação / Neoplasias Idioma: En Ano de publicação: 2022 Tipo de documento: Article

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