Extensive Sampling of Molecular Dynamics Simulations to Identify Reliable Protein Structures for Optimized Virtual Screening Studies: The Case of the hTRPM8 Channel.

Gervasoni, Silvia; Talarico, Carmine; Manelfi, Candida; Pedretti, Alessandro; Vistoli, Giulio; Beccari, Andrea R

Gervasoni, Silvia; Talarico, Carmine; Manelfi, Candida; Pedretti, Alessandro; Vistoli, Giulio; Beccari, Andrea R.

Afiliação

Gervasoni S; Dipartimento di Scienze Farmaceutiche, Università degli Studi di Milano, Via Luigi Mangiagalli, 25, I-20133 Milano, Italy.
Talarico C; Dompé Farmaceutici SpA, EXSCALATE Labs, Via Tommaso De Amicis, 95, I-80131 Napoli, Italy.
Manelfi C; Dompé Farmaceutici SpA, EXSCALATE Labs, Via Tommaso De Amicis, 95, I-80131 Napoli, Italy.
Pedretti A; Dipartimento di Scienze Farmaceutiche, Università degli Studi di Milano, Via Luigi Mangiagalli, 25, I-20133 Milano, Italy.
Vistoli G; Dipartimento di Scienze Farmaceutiche, Università degli Studi di Milano, Via Luigi Mangiagalli, 25, I-20133 Milano, Italy.
Beccari AR; Dompé Farmaceutici SpA, EXSCALATE Labs, Via Tommaso De Amicis, 95, I-80131 Napoli, Italy.

Int J Mol Sci ; 23(14)2022 Jul 08.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-35886905

Assuntos

Simulação de Dinâmica Molecular; Proteínas; Sítios de Ligação; Ligantes; Simulação de Acoplamento Molecular; Ligação Proteica; Proteínas/química

Palavras-chave

EFO algorithm; LiGen software; MD simulations; consensus models; hTRPM8; systematic sampling; virtual screening

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Texto completo: 1 Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Proteínas / Simulação de Dinâmica Molecular Idioma: En Ano de publicação: 2022 Tipo de documento: Article

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