Single Nucleotide Polymorphism-Based Real-Time PCR Screening Assay for Rapid Tracking of Bacterial Infection Clusters To Complement Whole-Genome Sequencing Efforts during Outbreak Investigations.

Treffon, Janina; Heppner, Bianca; Eismann, Julia; Bothe, Julia; Omengo, Birgit; Mellmann, Alexander

Treffon, Janina; Heppner, Bianca; Eismann, Julia; Bothe, Julia; Omengo, Birgit; Mellmann, Alexander.

Afiliação

Treffon J; University Hospital Münster, Institute of Hygiene, Münster, Germany.
Heppner B; University Hospital Münster, Institute of Hygiene, Münster, Germany.
Eismann J; inno-train Diagnostik GmbH, Kronberg, Germany.
Bothe J; inno-train Diagnostik GmbH, Kronberg, Germany.
Omengo B; inno-train Diagnostik GmbH, Kronberg, Germany.
Mellmann A; University Hospital Münster, Institute of Hygiene, Münster, Germany.

Microbiol Spectr ; 10(6): e0303622, 2022 12 21.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-36250868

Assuntos

Infecções Bacterianas; Humanos; Infecções Bacterianas/genética; Infecções Bacterianas/microbiologia; Surtos de Doenças; Genoma Bacteriano; Polimorfismo de Nucleotídeo Único; Reação em Cadeia da Polimerase em Tempo Real

Palavras-chave

cluster detection; genome sequencing; real-time PCR; signature search; single nucleotide polymorphisms; software evaluation

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Texto completo: 1 Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Infecções Bacterianas Idioma: En Ano de publicação: 2022 Tipo de documento: Article

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