Analysis of 5S rDNA Genomic Organization Through the RepeatExplorer2 Pipeline: A Simplified Protocol.

Garcia, Sònia; Pascual-Díaz, Joan Pere; Krumpolcová, Alice; Kovarík, Ales

Garcia, Sònia; Pascual-Díaz, Joan Pere; Krumpolcová, Alice; Kovarík, Ales.

Afiliação

Garcia S; Institut Botànic de Barcelona (CSIC - Ajuntament de Barcelona), Barcelona, Spain.
Pascual-Díaz JP; Institut Botànic de Barcelona (CSIC - Ajuntament de Barcelona), Barcelona, Spain.
Krumpolcová A; Department of Molecular Epigenetics, Institute of Biophysics, Academy of Sciences of the Czech Republic, Brno, Czech Republic.
Kovarík A; Department of Experimental Biology, Faculty of Science, Masaryk University, Brno, Czech Republic.

Methods Mol Biol ; 2672: 501-512, 2023.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-37335496

Assuntos

Genômica; RNA Ribossômico 5S; DNA Ribossômico/genética; Filogenia; RNA Ribossômico 5S/genética; Genes de RNAr

Palavras-chave

5S ribosomal RNA genes; Allopolyploid hybridization; Genomic analysis; Graph clustering; Homoploid hybridization; Introgression; Repeatome

Texto completo

Imprimir

XML

PubMed Links

Buscar no Google

Texto completo: 1 Base de dados: MEDLINE Assunto principal: RNA Ribossômico 5S / Genômica Idioma: En Ano de publicação: 2023 Tipo de documento: Article

Texto completo

Imprimir

XML

PubMed Links

Buscar no Google

Texto completo: 1 Base de dados: MEDLINE Assunto principal: RNA Ribossômico 5S / Genômica Idioma: En Ano de publicação: 2023 Tipo de documento: Article