Transfer learning for clustering single-cell RNA-seq data crossing-species and batch, case on uterine fibroids.

Wang, Yu Mei; Sun, Yuzhi; Wang, Beiying; Wu, Zhiping; He, Xiao Ying; Zhao, Yuansong

Wang, Yu Mei; Sun, Yuzhi; Wang, Beiying; Wu, Zhiping; He, Xiao Ying; Zhao, Yuansong.

Afiliação

Wang YM; Department of Gynecology, Shanghai First Maternity and Infant Hospital, School of Medicine, Tong Ji University, Shanghai , China.
Sun Y; Shanghai Key Laboratory of Maternal and Fetal Medicine, Shanghai First Maternity and Infant Hospital, Shanghai,China.
Wang B; School of Computer Science and Technology, Harbin Institute of Technology, Harbin, China.
Wu Z; Department of Gynecology, Shanghai First Maternity and Infant Hospital, School of Medicine, Tong Ji University, Shanghai , China.
He XY; Shanghai Key Laboratory of Maternal and Fetal Medicine, Shanghai First Maternity and Infant Hospital, Shanghai,China.
Zhao Y; Department of Gynecology, Shanghai First Maternity and Infant Hospital, School of Medicine, Tong Ji University, Shanghai , China.

Brief Bioinform ; 25(1)2023 11 22.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-37991248

Assuntos

Perfilação da Expressão Gênica; Leiomioma; Humanos; Perfilação da Expressão Gênica/métodos; Algoritmos; Análise de Sequência de RNA/métodos; Análise da Expressão Gênica de Célula Única; Análise de Célula Única/métodos; Análise por Conglomerados; Aprendizado de Máquina

Palavras-chave

batch effect; graph convolutional networks; single-cell RNA-seq data; transfer learning; uterine fibroids

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Texto completo: 1 Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Perfilação da Expressão Gênica / Leiomioma Idioma: En Ano de publicação: 2023 Tipo de documento: Article

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