Degenerate ITS7 primer enhances oomycete community coverage and PCR sensitivity to Aphanomyces species, economically important plant pathogens.

Esmaeili Taheri, A; Chatterton, S; Gossen, B D; McLaren, D L

Esmaeili Taheri, A; Chatterton, S; Gossen, B D; McLaren, D L.

Afiliación

Esmaeili Taheri A; a Lethbridge Research and Development Centre, Agriculture and Agri-Food Canada (AAFC), Lethbridge, AB T1J 4B1, Canada.
Chatterton S; a Lethbridge Research and Development Centre, Agriculture and Agri-Food Canada (AAFC), Lethbridge, AB T1J 4B1, Canada.
Gossen BD; b Saskatoon Research and Development Centre, AAFC, Saskatoon, SK S7N 0X2, Canada.
McLaren DL; c Brandon Research and Development Centre, AAFC, Brandon, MB R7A 5Y3, Canada.

Can J Microbiol ; 63(9): 769-779, 2017 Sep.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-28576113

Asunto(s)

Aphanomyces/genética; Cartilla de ADN/genética; Pisum sativum/parasitología; Enfermedades de las Plantas/parasitología; Pythium/aislamiento & purificación; Aphanomyces/clasificación; Aphanomyces/aislamiento & purificación; Secuenciación de Nucleótidos de Alto Rendimiento; Raíces de Plantas/parasitología; Reacción en Cadena de la Polimerasa; Pythium/clasificación; Pythium/genética

Palabras clave

Aphanomyces euteiches; Illumina MiSeq; MiSeq qu'Illumina; PCR; Pythium spp.; communautés d'oomycètes; metagenomics; métagénomique; next-generation sequencing; oomycete communities; optimisation des amorces; pea root rot; pourridié du pois; primer optimization; séquençage de nouvelle génération

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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Banco de datos: MEDLINE Asunto principal: Enfermedades de las Plantas / Pythium / Cartilla de ADN / Pisum sativum / Aphanomyces Tipo de estudio: Diagnostic_studies / Health_economic_evaluation Idioma: En Revista: Can J Microbiol Año: 2017 Tipo del documento: Article País de afiliación: Canadá

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