Búsqueda | Portal de Búsqueda de la BVS

1.

The hidden world of transient enhancers.

Beekman, Renée.

Nat Rev Genet ; 2024 Apr 29.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-38684857

2.

Chromatin activation as a unifying principle underlying pathogenic mechanisms in multiple myeloma.

Ordoñez, Raquel; Kulis, Marta; Russiñol, Nuria; Chapaprieta, Vicente; Carrasco-Leon, Arantxa; García-Torre, Beatriz; Charalampopoulou, Stella; Clot, Guillem; Beekman, Renée; Meydan, Cem; Duran-Ferrer, Martí; Verdaguer-Dot, Núria; Vilarrasa-Blasi, Roser; Soler-Vila, Paula; Garate, Leire; Miranda, Estíbaliz; San José-Enériz, Edurne; Rodriguez-Madoz, Juan R; Ezponda, Teresa; Martínez-Turrilas, Rebeca; Vilas-Zornoza, Amaia; Lara-Astiaso, David; Dupéré-Richer, Daphné; Martens, Joost H A; El-Omri, Halima; Taha, Ruba Y; Calasanz, Maria J; Paiva, Bruno; San Miguel, Jesus; Flicek, Paul; Gut, Ivo; Melnick, Ari; Mitsiades, Constantine S; Licht, Jonathan D; Campo, Elias; Stunnenberg, Hendrik G; Agirre, Xabier; Prosper, Felipe; Martin-Subero, Jose I.

Genome Res ; 30(9): 1217-1227, 2020 09.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-32820006

3.

Non-coding recurrent mutations in chronic lymphocytic leukaemia.

Puente, Xose S; Beà, Silvia; Valdés-Mas, Rafael; Villamor, Neus; Gutiérrez-Abril, Jesús; Martín-Subero, José I; Munar, Marta; Rubio-Pérez, Carlota; Jares, Pedro; Aymerich, Marta; Baumann, Tycho; Beekman, Renée; Belver, Laura; Carrio, Anna; Castellano, Giancarlo; Clot, Guillem; Colado, Enrique; Colomer, Dolors; Costa, Dolors; Delgado, Julio; Enjuanes, Anna; Estivill, Xavier; Ferrando, Adolfo A; Gelpí, Josep L; González, Blanca; González, Santiago; González, Marcos; Gut, Marta; Hernández-Rivas, Jesús M; López-Guerra, Mónica; Martín-García, David; Navarro, Alba; Nicolás, Pilar; Orozco, Modesto; Payer, Ángel R; Pinyol, Magda; Pisano, David G; Puente, Diana A; Queirós, Ana C; Quesada, Víctor; Romeo-Casabona, Carlos M; Royo, Cristina; Royo, Romina; Rozman, María; Russiñol, Nuria; Salaverría, Itziar; Stamatopoulos, Kostas; Stunnenberg, Hendrik G; Tamborero, David; Terol, María J.

Nature ; 526(7574): 519-24, 2015 Oct 22.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-26200345

4.

An indirect perspective to link genetic mosaicism and tumorigenesis.

Albinati, Leone; Beekman, Renée.

Bioessays ; 46(7): e2400102, 2024 Jul.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-38713905

5.

SOX11, a key oncogenic factor in mantle cell lymphoma.

Beekman, Renée; Amador, Virginia; Campo, Elias.

Curr Opin Hematol ; 25(4): 299-306, 2018 07.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-29738333

6.

Whole-epigenome analysis in multiple myeloma reveals DNA hypermethylation of B cell-specific enhancers.

Agirre, Xabier; Castellano, Giancarlo; Pascual, Marien; Heath, Simon; Kulis, Marta; Segura, Victor; Bergmann, Anke; Esteve, Anna; Merkel, Angelika; Raineri, Emanuele; Agueda, Lidia; Blanc, Julie; Richardson, David; Clarke, Laura; Datta, Avik; Russiñol, Nuria; Queirós, Ana C; Beekman, Renée; Rodríguez-Madoz, Juan R; San José-Enériz, Edurne; Fang, Fang; Gutiérrez, Norma C; García-Verdugo, José M; Robson, Michael I; Schirmer, Eric C; Guruceaga, Elisabeth; Martens, Joost H A; Gut, Marta; Calasanz, Maria J; Flicek, Paul; Siebert, Reiner; Campo, Elías; Miguel, Jesús F San; Melnick, Ari; Stunnenberg, Hendrik G; Gut, Ivo G; Prosper, Felipe; Martín-Subero, José I.

Genome Res ; 25(4): 478-87, 2015 Apr.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-25644835

7.

Cooperativity of RUNX1 and CSF3R mutations in severe congenital neutropenia: a unique pathway in myeloid leukemogenesis.

Skokowa, Julia; Steinemann, Doris; Katsman-Kuipers, Jenny E; Zeidler, Cornelia; Klimenkova, Olga; Klimiankou, Maksim; Unalan, Murat; Kandabarau, Siarhei; Makaryan, Vahagn; Beekman, Renee; Behrens, Kira; Stocking, Carol; Obenauer, Julia; Schnittger, Susanne; Kohlmann, Alexander; Valkhof, Marijke G; Hoogenboezem, Remco; Göhring, Gudrun; Reinhardt, Dirk; Schlegelberger, Brigitte; Stanulla, Martin; Vandenberghe, Peter; Donadieu, Jean; Zwaan, C Michel; Touw, Ivo P; van den Heuvel-Eibrink, Marry M; Dale, David C; Welte, Karl.

Blood ; 123(14): 2229-37, 2014 Apr 03.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-24523240

8.

Intragenic DNA methylation in transcriptional regulation, normal differentiation and cancer.

Kulis, Marta; Queirós, Ana C; Beekman, Renée; Martín-Subero, José I.

Biochim Biophys Acta ; 1829(11): 1161-74, 2013 Nov.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-23938249

9.

Expression of the transcribed ultraconserved region 70 and the related long non-coding RNA AC092652.2-202 has prognostic value in Chronic Lymphocytic Leukaemia.

Bomben, Riccardo; Roisman, Alejandro; D'Agaro, Tiziana; Castellano, Giancarlo; Baumann, Tycho; Delgado, Julio; López-Guillermo, Armando; Zucchetto, Antonella; Dal-Bo, Michele; Bravin, Vanessa; Slavutsky, Irma; Vlasova, Anna; Guigó, Roderic; Martin-Subero, Jose I; Chapaprieta, Vicente; Beekman, Renee; Martin-García, David; Beà, Sílvia; Salaverria, Itziar; Aymerich, Marta; Campo, Elias; Gattei, Valter; Hernández, Luis.

Br J Haematol ; 184(6): 1045-1050, 2019 03.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-29687884

10.

Sequential gain of mutations in severe congenital neutropenia progressing to acute myeloid leukemia.

Beekman, Renée; Valkhof, Marijke G; Sanders, Mathijs A; van Strien, Paulette M H; Haanstra, Jurgen R; Broeders, Lianne; Geertsma-Kleinekoort, Wendy M; Veerman, Anjo J P; Valk, Peter J M; Verhaak, Roel G; Löwenberg, Bob; Touw, Ivo P.

Blood ; 119(22): 5071-7, 2012 May 31.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-22371884

11.

Shelterins, a genetic crossroad in CLL.

Beekman, Renée; Campo, Elias.

Blood ; 128(19): 2279-2280, 2016 11 10.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-28829750

12.

G-CSF and its receptor in myeloid malignancy.

Beekman, Renée; Touw, Ivo P.

Blood ; 115(25): 5131-6, 2010 Jun 24.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-20237318

13.

scTAM-seq enables targeted high-confidence analysis of DNA methylation in single cells.

Bianchi, Agostina; Scherer, Michael; Zaurin, Roser; Quililan, Kimberly; Velten, Lars; Beekman, Renée.

Genome Biol ; 23(1): 229, 2022 10 28.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-36307828

14.

Dynamics of genome architecture and chromatin function during human B cell differentiation and neoplastic transformation.

Vilarrasa-Blasi, Roser; Soler-Vila, Paula; Verdaguer-Dot, Núria; Russiñol, Núria; Di Stefano, Marco; Chapaprieta, Vicente; Clot, Guillem; Farabella, Irene; Cuscó, Pol; Kulis, Marta; Agirre, Xabier; Prosper, Felipe; Beekman, Renée; Beà, Silvia; Colomer, Dolors; Stunnenberg, Hendrik G; Gut, Ivo; Campo, Elias; Marti-Renom, Marc A; Martin-Subero, José Ignacio.

Nat Commun ; 12(1): 651, 2021 01 28.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-33510161

15.

Mutational mechanisms shaping the coding and noncoding genome of germinal center derived B-cell lymphomas.

Hübschmann, Daniel; Kleinheinz, Kortine; Wagener, Rabea; Bernhart, Stephan H; López, Cristina; Toprak, Umut H; Sungalee, Stephanie; Ishaque, Naveed; Kretzmer, Helene; Kreuz, Markus; Waszak, Sebastian M; Paramasivam, Nagarajan; Ammerpohl, Ole; Aukema, Sietse M; Beekman, Renée; Bergmann, Anke K; Bieg, Matthias; Binder, Hans; Borkhardt, Arndt; Borst, Christoph; Brors, Benedikt; Bruns, Philipp; Carrillo de Santa Pau, Enrique; Claviez, Alexander; Doose, Gero; Haake, Andrea; Karsch, Dennis; Haas, Siegfried; Hansmann, Martin-Leo; Hoell, Jessica I; Hovestadt, Volker; Huang, Bingding; Hummel, Michael; Jäger-Schmidt, Christina; Kerssemakers, Jules N A; Korbel, Jan O; Kube, Dieter; Lawerenz, Chris; Lenze, Dido; Martens, Joost H A; Ott, German; Radlwimmer, Bernhard; Reisinger, Eva; Richter, Julia; Rico, Daniel; Rosenstiel, Philip; Rosenwald, Andreas; Schillhabel, Markus; Stilgenbauer, Stephan; Stadler, Peter F.

Leukemia ; 35(7): 2002-2016, 2021 07.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-33953289

16.

HAT: hypergeometric analysis of tiling-arrays with application to promoter-GeneChip data.

Taskesen, Erdogan; Beekman, Renee; de Ridder, Jeroen; Wouters, Bas J; Peeters, Justine K; Touw, Ivo P; Reinders, Marcel J T; Delwel, Ruud.

BMC Bioinformatics ; 11: 275, 2010 May 21.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-20492700

17.

The proliferative history shapes the DNA methylome of B-cell tumors and predicts clinical outcome.

Duran-Ferrer, Martí; Clot, Guillem; Nadeu, Ferran; Beekman, Renée; Baumann, Tycho; Nordlund, Jessica; Marincevic-Zuniga, Yanara; Lönnerholm, Gudmar; Rivas-Delgado, Alfredo; Martín, Silvia; Ordoñez, Raquel; Castellano, Giancarlo; Kulis, Marta; Queirós, Ana C; Lee, Seung-Tae; Wiemels, Joseph; Royo, Romina; Puiggrós, Montserrat; Lu, Junyan; Giné, Eva; Beà, Sílvia; Jares, Pedro; Agirre, Xabier; Prosper, Felipe; López-Otín, Carlos; Puente, Xosé S; Oakes, Christopher C; Zenz, Thorsten; Delgado, Julio; López-Guillermo, Armando; Campo, Elías; Martín-Subero, José Ignacio.

Nat Cancer ; 1(11): 1066-1081, 2020 11.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-34079956

18.

Insight into genetic predisposition to chronic lymphocytic leukemia from integrative epigenomics.

Speedy, Helen E; Beekman, Renée; Chapaprieta, Vicente; Orlando, Giulia; Law, Philip J; Martín-García, David; Gutiérrez-Abril, Jesús; Catovsky, Daniel; Beà, Sílvia; Clot, Guillem; Puiggròs, Montserrat; Torrents, David; Puente, Xose S; Allan, James M; López-Otín, Carlos; Campo, Elias; Houlston, Richard S; Martín-Subero, José I.

Nat Commun ; 10(1): 3615, 2019 08 09.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-31399598

19.

Myeloid transforming protein Evi1 interacts with methyl-CpG binding domain protein 3 and inhibits in vitro histone deacetylation by Mbd3/Mi-2/NuRD.

Spensberger, Dominik; Vermeulen, Michiel; Le Guezennec, Xavier; Beekman, Renee; van Hoven, Antoinette; Bindels, Eric; Stunnenberg, Henk; Delwel, Ruud.

Biochemistry ; 47(24): 6418-26, 2008 Jun 17.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-18500823

20.

Severe congenital neutropenia and chronic neutrophilic leukemia: an intriguing molecular connection unveiled by oncogenic mutations in CSF3R.

Touw, Ivo P; Beekman, Renée.

Haematologica ; 98(10): 1490-2, 2013 Oct.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-24091926

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