RESUMEN
On 24th November 2021, the sequence of a new SARS-CoV-2 viral isolate Omicron-B.1.1.529 was announced, containing far more mutations in Spike (S) than previously reported variants. Neutralization titers of Omicron by sera from vaccinees and convalescent subjects infected with early pandemic Alpha, Beta, Gamma, or Delta are substantially reduced, or the sera failed to neutralize. Titers against Omicron are boosted by third vaccine doses and are high in both vaccinated individuals and those infected by Delta. Mutations in Omicron knock out or substantially reduce neutralization by most of the large panel of potent monoclonal antibodies and antibodies under commercial development. Omicron S has structural changes from earlier viruses and uses mutations that confer tight binding to ACE2 to unleash evolution driven by immune escape. This leads to a large number of mutations in the ACE2 binding site and rebalances receptor affinity to that of earlier pandemic viruses.
RESUMEN
On the 24 th November 2021 the sequence of a new SARS CoV-2 viral isolate spreading rapidly in Southern Africa was announced, containing far more mutations in Spike (S) than previously reported variants. Neutralization titres of Omicron by sera from vaccinees and convalescent subjects infected with early pandemic as well as Alpha, Beta, Gamma, Delta are substantially reduced or fail to neutralize. Titres against Omicron are boosted by third vaccine doses and are high in cases both vaccinated and infected by Delta. Mutations in Omicron knock out or substantially reduce neutralization by most of a large panel of potent monoclonal antibodies and antibodies under commercial development. Omicron S has structural changes from earlier viruses, combining mutations conferring tight binding to ACE2 to unleash evolution driven by immune escape, leading to a large number of mutations in the ACE2 binding site which rebalance receptor affinity to that of early pandemic viruses.
RESUMEN
A Variante de Preocupação Ômicron (B.1.1.529) trouxe uma grande expansão mundial dos contágios pelo SARS-CoV-2, mesmo em países onde a imunização contra o vírus já estava avançada. Para compreender como a coleção de mutações da Glicoproteína S da Ômicron leva ao escape da resposta imunológica, um esforço internacional de pesquisa que incluiu cientistas da Rede Genômica Fiocruz analisou as estruturas de proteínas, além da neutralização da capacidade de causar infecção ao expôr amostras da Ômicron a diferentes preparados contendo anticorpos como: 1) o soro de pacientes infectados com outras amostras do vírus, 2) os chamados "anticorpos monoclonais" selecionados em laboratório, e 3) o soro de pessoas vacinadas.O presente artigo, fruto desta colaboração para o estudo de múltiplos fatores envolvidos no escape da resposta imune apresentado pela Ômicron, demonstrou que a nova variante é quase 17 vezes mais resistente à neutralização pelos anticorpos gerados em resposta a uma linhagem da primeira onda da pandemia. O estudo mostra ainda que um esquema vacinal de três doses aumenta consideravelmente a resposta ao vírus, incluindo a neutralização da variante Ômicron, que não era suficiente apenas com duas doses do imunizante. O artigo mostra ainda que a estrutura de porções da Glicoproteína S da Ômicron estão envolvidas em "compensar" a ação de anticorpos através de uma ligação mais forte à ACE2, molécula que atua como receptor viral nas células humanas.