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1.
Nucleic Acids Res ; 42(Database issue): D114-22, 2014 Jan.
Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-24185695

RESUMEN

The Nucleic Acid Database (NDB) (http://ndbserver.rutgers.edu) is a web portal providing access to information about 3D nucleic acid structures and their complexes. In addition to primary data, the NDB contains derived geometric data, classifications of structures and motifs, standards for describing nucleic acid features, as well as tools and software for the analysis of nucleic acids. A variety of search capabilities are available, as are many different types of reports. This article describes the recent redesign of the NDB Web site with special emphasis on new RNA-derived data and annotations and their implementation and integration into the search capabilities.


Asunto(s)
Bases de Datos de Ácidos Nucleicos , Conformación de Ácido Nucleico , ADN/química , Internet , Ácidos Nucleicos/clasificación , Motivos de Nucleótidos , ARN/química , Programas Informáticos
2.
FEBS Lett ; 587(8): 1036-45, 2013 Apr 17.
Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-23337870

RESUMEN

The Protein Data Bank (PDB) was established in 1971 as a repository for the three dimensional structures of biological macromolecules. Since then, more than 85000 biological macromolecule structures have been determined and made available in the PDB archive. Through analysis of the corpus of data, it is possible to identify trends that can be used to inform us abou the future of structural biology and to plan the best ways to improve the management of the ever-growing amount of PDB data.


Asunto(s)
Bases de Datos de Proteínas/estadística & datos numéricos , Almacenamiento y Recuperación de la Información/estadística & datos numéricos , Conformación Proteica , Proteínas/química , Cristalografía por Rayos X , Bases de Datos de Proteínas/tendencias , Almacenamiento y Recuperación de la Información/tendencias , Modelos Moleculares , Conformación de Ácido Nucleico , Ácidos Nucleicos/química , Ácidos Nucleicos/metabolismo , Unión Proteica , Proteínas/metabolismo
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