Detalles de la búsqueda
1.
The impact of G-quadruplex dynamics on inter-tetrad electronic couplings: a hybrid computational study.
Phys Chem Chem Phys
; 24(37): 22513-22522, 2022 Sep 28.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36106845
2.
Landscape of DNA binding signatures of myocyte enhancer factor-2B reveals a unique interplay of base and shape readout.
Nucleic Acids Res
; 48(15): 8529-8544, 2020 09 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32738045
3.
The RNA Polymerase α Subunit Recognizes the DNA Shape of the Upstream Promoter Element.
Biochemistry
; 59(48): 4523-4532, 2020 12 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33205945
4.
Vacancies in graphene: an application of adiabatic quantum optimization.
Phys Chem Chem Phys
; 22(46): 27332-27337, 2020 Dec 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33231234
5.
Adsorption Mechanisms of Nucleobases on the Hydrated Au(111) Surface.
Langmuir
; 34(49): 14749-14756, 2018 12 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29723478
6.
Conformations of Human Telomeric G-Quadruplex Studied Using a Nucleotide-Independent Nitroxide Label.
Biochemistry
; 55(2): 360-72, 2016 Jan 19.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26678746
7.
Control of DNA minor groove width and Fis protein binding by the purine 2-amino group.
Nucleic Acids Res
; 41(13): 6750-60, 2013 Jul.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23661683
8.
DNAshape: a method for the high-throughput prediction of DNA structural features on a genomic scale.
Nucleic Acids Res
; 41(Web Server issue): W56-62, 2013 Jul.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23703209
9.
Unraveling the mechanism of tip-enhanced molecular energy transfer.
Commun Chem
; 7(1): 32, 2024 Feb 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38360897
10.
A Perspective on Sustainable Computational Chemistry Software Development and Integration.
J Chem Theory Comput
; 19(20): 7056-7076, 2023 Oct 24.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37769271
11.
Electrical behaviour of heterobimetallic [MM'(EtCS2)4] (MM'=NiPd, NiPt, PdPt) and MM'X-chain polymers [PtM(EtCS2)4I] (M=Ni, Pd).
Chemistry
; 18(48): 15476-84, 2012 Nov 26.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23060135
12.
Combined effects of metal complexation and size expansion in the electronic structure of DNA base pairs.
J Chem Phys
; 134(20): 205102, 2011 May 28.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-21639482
13.
LCAO Electronic Structure of Nucleic Acid Bases and Other Heterocycles and Transfer Integrals in B-DNA, Including Structural Variability.
Materials (Basel)
; 14(17)2021 Aug 30.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34501020
14.
Effects of Structural Dynamics on Charge Carrier Transfer in B-DNA: A Combined MD and RT-TDDFT Study.
J Phys Chem B
; 125(16): 3986-4003, 2021 04 29.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33857373
15.
Hydroxyl-rich beta-sheet adhesion to the gold surface in water by first-principle simulations.
J Am Chem Soc
; 132(13): 4790-5, 2010 Apr 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-20225820
16.
Protein-surface interactions: challenging experiments and computations.
J Mol Recognit
; 23(3): 259-62, 2010.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-19950121
17.
Protein-Mutation-Induced Conformational Changes of the DNA and Nuclease Domain in CRISPR/Cas9 Systems by Molecular Dynamics Simulations.
J Phys Chem B
; 124(11): 2168-2179, 2020 03 19.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-32079396
18.
Porphyrin intercalation in G4-DNA quadruplexes by molecular dynamics simulations.
J Phys Chem B
; 113(40): 13152-60, 2009 Oct 08.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-19754127
19.
First principles effective electronic couplings for hole transfer in natural and size-expanded DNA.
J Phys Chem B
; 113(28): 9402-15, 2009 Jul 16.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-19537767
20.
Fingerprints of bonding motifs in DNA duplexes of adenine and thymine revealed from circular dichroism: synchrotron radiation experiments and TDDFT calculations.
J Phys Chem B
; 113(28): 9614-9, 2009 Jul 16.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-19537699