Detalles de la búsqueda
1.
High UV damage and low repair, but not cytosine deamination, stimulate mutation hotspots at ETS binding sites in melanoma.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 121(4): e2310854121, 2024 Jan 23.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38241433
2.
DNA mismatches reveal conformational penalties in protein-DNA recognition.
Nature
; 587(7833): 291-296, 2020 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33087930
3.
UV irradiation remodels the specificity landscape of transcription factors.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 120(11): e2217422120, 2023 03 14.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36888663
4.
High-throughput data and modeling reveal insights into the mechanisms of cooperative DNA-binding by transcription factor proteins.
Nucleic Acids Res
; 51(21): 11600-11612, 2023 Nov 27.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37889068
5.
Competition for DNA binding between paralogous transcription factors determines their genomic occupancy and regulatory functions.
Genome Res
; 31(7): 1216-1229, 2021 Jul.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33975875
6.
QBiC-Pred: quantitative predictions of transcription factor binding changes due to sequence variants.
Nucleic Acids Res
; 47(W1): W127-W135, 2019 07 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31114870
7.
Inkjet-printed point-of-care immunoassay on a nanoscale polymer brush enables subpicomolar detection of analytes in blood.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 114(34): E7054-E7062, 2017 08 22.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28784765
8.
Incomplete MyoD-induced transdifferentiation is associated with chromatin remodeling deficiencies.
Nucleic Acids Res
; 45(20): 11684-11699, 2017 Nov 16.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28977539
9.
Absence of a simple code: how transcription factors read the genome.
Trends Biochem Sci
; 39(9): 381-99, 2014 Sep.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25129887
10.
Quantitative modeling of transcription factor binding specificities using DNA shape.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 112(15): 4654-9, 2015 Apr 14.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25775564
11.
Protein-DNA binding in the absence of specific base-pair recognition.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 111(48): 17140-5, 2014 Dec 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25313048
12.
Nonconsensus Protein Binding to Repetitive DNA Sequence Elements Significantly Affects Eukaryotic Genomes.
PLoS Comput Biol
; 11(8): e1004429, 2015 Aug.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26285121
13.
Protein-DNA binding: complexities and multi-protein codes.
Nucleic Acids Res
; 42(4): 2099-111, 2014 Feb.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24243859
14.
COUGER--co-factors associated with uniquely-bound genomic regions.
Nucleic Acids Res
; 42(Web Server issue): W461-7, 2014 Jul.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24861628
15.
TFBSshape: a motif database for DNA shape features of transcription factor binding sites.
Nucleic Acids Res
; 42(Database issue): D148-55, 2014 Jan.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24214955
16.
Stability selection for regression-based models of transcription factor-DNA binding specificity.
Bioinformatics
; 29(13): i117-25, 2013 Jul 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23812975
17.
Drosophila ORC localizes to open chromatin and marks sites of cohesin complex loading.
Genome Res
; 20(2): 201-11, 2010 Feb.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-19996087
18.
Identification of Tat-SF1 cellular targets by exon array analysis reveals dual roles in transcription and splicing.
RNA
; 17(4): 665-74, 2011 Apr.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-21282347
19.
Computational design of sequence-specific DNA-binding proteins.
bioRxiv
; 2023 Sep 21.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37790440
20.
Short tandem repeats bind transcription factors to tune eukaryotic gene expression.
Science
; 381(6664): eadd1250, 2023 09 22.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37733848