Detalles de la búsqueda
1.
Efficient computation of Faith's phylogenetic diversity with applications in characterizing microbiomes.
Genome Res
; 31(11): 2131-2137, 2021 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34479875
2.
Challenges in benchmarking metagenomic profilers.
Nat Methods
; 18(6): 618-626, 2021 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33986544
3.
Utilizing stability criteria in choosing feature selection methods yields reproducible results in microbiome data.
Biometrics
; 78(3): 1155-1167, 2022 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33914902
4.
Haplotype assembly of autotetraploid potato using integer linear programing.
Bioinformatics
; 35(18): 3279-3286, 2019 09 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30689725
5.
Signal enrichment with strain-level resolution in metagenomes using topological data analysis.
BMC Genomics
; 20(Suppl 2): 194, 2019 Apr 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30967115
6.
Transcriptome characterization and differentially expressed genes under flooding and drought stress in the biomass grasses Phalaris arundinacea and Dactylis glomerata.
Ann Bot
; 124(4): 717-730, 2019 10 29.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31241131
7.
SimBA: simulation algorithm to fit extant-population distributions.
BMC Bioinformatics
; 16: 82, 2015 Mar 14.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25886895
8.
Haplotype assembly of autotetraploid potato using integer linear programing.
Bioinformatics
; 35(21): 4534, 2019 Nov 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31280288
9.
Comparative exomics of Phalaris cultivars under salt stress.
BMC Genomics
; 15 Suppl 6: S18, 2014.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25573273
10.
GenomicTools: a computational platform for developing high-throughput analytics in genomics.
Bioinformatics
; 28(2): 282-3, 2012 Jan 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-22113082
11.
iXora: exact haplotype inferencing and trait association.
BMC Genet
; 14: 48, 2013 Jun 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23742238
12.
Phylogeny-Aware Analysis of Metagenome Community Ecology Based on Matched Reference Genomes while Bypassing Taxonomy.
mSystems
; 7(2): e0016722, 2022 04 26.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35369727
13.
Standardized multi-omics of Earth's microbiomes reveals microbial and metabolite diversity.
Nat Microbiol
; 7(12): 2128-2150, 2022 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36443458
14.
Randomization techniques for assessing the significance of gene periodicity results.
BMC Bioinformatics
; 12: 330, 2011 Aug 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-21827656
15.
Assessing pooled BAC and whole genome shotgun strategies for assembly of complex genomes.
BMC Genomics
; 12: 194, 2011 Apr 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-21496274
16.
Sequencing of a QTL-rich region of the Theobroma cacao genome using pooled BACs and the identification of trait specific candidate genes.
BMC Genomics
; 12: 379, 2011 Jul 27.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-21794110
17.
Functional profiling of COVID-19 respiratory tract microbiomes.
Sci Rep
; 11(1): 6433, 2021 03 19.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33742096
18.
Re-purposing software for functional characterization of the microbiome.
Microbiome
; 9(1): 4, 2021 01 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33422152
19.
DNA Extraction and Host Depletion Methods Significantly Impact and Potentially Bias Bacterial Detection in a Biological Fluid.
mSystems
; 6(3): e0061921, 2021 Jun 29.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34128697
20.
Explainable AI reveals changes in skin microbiome composition linked to phenotypic differences.
Sci Rep
; 11(1): 4565, 2021 02 25.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33633172