Detalles de la búsqueda
1.
Spectral averaging with outlier rejection algorithms to increase identifications in top-down proteomics.
Proteomics
; 24(8): e2300234, 2024 Apr.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38487981
2.
Defining Distinct RNA-Protein Interactomes of SARS-CoV-2 Genomic and Subgenomic RNAs.
J Proteome Res
; 23(1): 149-160, 2024 01 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38043095
3.
Quantitative proteome-wide O-glycoproteomics analysis with FragPipe.
Anal Bioanal Chem
; 2024 Jun 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38877149
4.
Newly synthesized glycoprotein profiling to identify molecular signatures of warm ischemic injury in donor lungs.
Am J Physiol Lung Cell Mol Physiol
; 325(1): L30-L44, 2023 07 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37130807
5.
Cysteine Counting via Isotopic Chemical Labeling for Intact Mass Proteoform Identifications in Tissue.
Anal Chem
; 95(41): 15245-15253, 2023 10 17.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37791746
6.
Elucidating the RNA-Protein Interactomes of Target RNAs in Tissue.
Anal Chem
; 95(18): 7087-7092, 2023 05 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37093976
7.
O-Pair Search with MetaMorpheus for O-glycopeptide characterization.
Nat Methods
; 17(11): 1133-1138, 2020 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33106676
8.
Overview and considerations in bottom-up proteomics.
Analyst
; 148(3): 475-486, 2023 Jan 31.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36383138
9.
A Hybrid Spectral Library and Protein Sequence Database Search Strategy for Bottom-Up and Top-Down Proteomic Data Analysis.
J Proteome Res
; 21(11): 2609-2618, 2022 11 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36206157
10.
Discovery of Dehydroamino Acid Residues in the Capsid and Matrix Structural Proteins of HIV-1.
J Proteome Res
; 21(4): 993-1001, 2022 04 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35192358
11.
Putting Humpty Dumpty Back Together Again: What Does Protein Quantification Mean in Bottom-Up Proteomics?
J Proteome Res
; 21(4): 891-898, 2022 04 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35220718
12.
MetaNetwork Enhances Biological Insights from Quantitative Proteomics Differences by Combining Clustering and Enrichment Analyses.
J Proteome Res
; 21(2): 410-419, 2022 02 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35073098
13.
Fused in sarcoma regulates DNA replication timing and kinetics.
J Biol Chem
; 297(3): 101049, 2021 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34375640
14.
Best practices and benchmarks for intact protein analysis for top-down mass spectrometry.
Nat Methods
; 16(7): 587-594, 2019 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31249407
15.
Towards an Ideal In Cell Hybridization-Based Strategy to Discover Protein Interactomes of Selected RNA Molecules.
Int J Mol Sci
; 23(2)2022 Jan 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35055128
16.
Internal Fragment Ions Disambiguate and Increase Identifications in Top-Down Proteomics.
J Proteome Res
; 20(12): 5412-5418, 2021 12 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34738820
17.
Automated Assignment of Proteoform Classification Levels.
J Proteome Res
; 20(8): 4101-4105, 2021 08 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34181432
18.
ProteaseGuru: A Tool for Protease Selection in Bottom-Up Proteomics.
J Proteome Res
; 20(4): 1936-1942, 2021 04 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33661641
19.
Binary Classifier for Computing Posterior Error Probabilities in MetaMorpheus.
J Proteome Res
; 20(4): 1997-2004, 2021 04 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33683901
20.
Construction of Human Proteoform Families from 21 Tesla Fourier Transform Ion Cyclotron Resonance Mass Spectrometry Top-Down Proteomic Data.
J Proteome Res
; 20(1): 317-325, 2021 01 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33074679