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1.
Bioinformatics ; 29(23): 3100-1, 2013 Dec 01.
Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-24021386

RESUMEN

Studies of the human microbiome, and microbial community ecology in general, have blossomed of late and are now a burgeoning source of exciting research findings. Along with the advent of next-generation sequencing platforms, which have dramatically increased the scope of microbiome-related projects, several high-performance sequence analysis pipelines (e.g. QIIME, MOTHUR, VAMPS) are now available to investigators for microbiome analysis. The subject of our manuscript, the graphical user interface-based Explicet software package, fills a previously unmet need for a robust, yet intuitive means of integrating the outputs of the software pipelines with user-specified metadata and then visualizing the combined data.


Asunto(s)
Gráficos por Computador , Sistemas de Administración de Bases de Datos , Microbiota/genética , Programas Informáticos , Interfaz Usuario-Computador , Biología Computacional , Secuenciación de Nucleótidos de Alto Rendimiento , Humanos , Metagenoma , Análisis de Secuencia de ADN
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