Detalles de la búsqueda
1.
Large-scale structure-informed multiple sequence alignment of proteins with SIMSApiper.
Bioinformatics
; 40(5)2024 May 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38648741
2.
Deciphering the RRM-RNA recognition code: A computational analysis.
PLoS Comput Biol
; 19(1): e1010859, 2023 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36689472
3.
New simulation insights on the structural transition mechanism of bovine rhodopsin activation.
Proteins
; 91(6): 771-780, 2023 06.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-36629258
4.
MobiDB: intrinsically disordered proteins in 2021.
Nucleic Acids Res
; 49(D1): D361-D367, 2021 01 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33237329
5.
Panoramic Perspective on Human Phosphosites.
J Proteome Res
; 21(8): 1894-1915, 2022 08 05.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-35793420
6.
ShiftCrypt: a web server to understand and biophysically align proteins through their NMR chemical shift values.
Nucleic Acids Res
; 48(W1): W36-W40, 2020 07 02.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-32459331
7.
Computational identification of prion-like RNA-binding proteins that form liquid phase-separated condensates.
Bioinformatics
; 35(22): 4617-4623, 2019 11 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30994888
8.
AmyPro: a database of proteins with validated amyloidogenic regions.
Nucleic Acids Res
; 46(D1): D387-D392, 2018 01 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29040693
9.
MobiDB 3.0: more annotations for intrinsic disorder, conformational diversity and interactions in proteins.
Nucleic Acids Res
; 46(D1): D471-D476, 2018 01 04.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-29136219
10.
RINspector: a Cytoscape app for centrality analyses and DynaMine flexibility prediction.
Bioinformatics
; 34(2): 294-296, 2018 Jan 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29028877
11.
Ultra-fast global homology detection with Discrete Cosine Transform and Dynamic Time Warping.
Bioinformatics
; 34(18): 3118-3125, 2018 09 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29684140
12.
SVM-dependent pairwise HMM: an application to protein pairwise alignments.
Bioinformatics
; 33(24): 3902-3908, 2017 Dec 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28666322
13.
Seeing the trees through the forest: sequence-based homo- and heteromeric protein-protein interaction sites prediction using random forest.
Bioinformatics
; 33(10): 1479-1487, 2017 May 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28073761
14.
Start2Fold: a database of hydrogen/deuterium exchange data on protein folding and stability.
Nucleic Acids Res
; 44(D1): D429-34, 2016 Jan 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26582925
15.
Investigating the Molecular Mechanisms Behind Uncharacterized Cysteine Losses from Prediction of Their Oxidation State.
Hum Mutat
; 38(1): 86-94, 2017 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27667481
16.
Multilevel biological characterization of exomic variants at the protein level significantly improves the identification of their deleterious effects.
Bioinformatics
; 32(12): 1797-804, 2016 06 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27153718
17.
Early Folding Events, Local Interactions, and Conservation of Protein Backbone Rigidity.
Biophys J
; 110(3): 572-583, 2016 Feb 02.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-26840723
18.
Clustering-based model of cysteine co-evolution improves disulfide bond connectivity prediction and reduces homologous sequence requirements.
Bioinformatics
; 31(8): 1219-25, 2015 Apr 15.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-25492406
19.
The DynaMine webserver: predicting protein dynamics from sequence.
Nucleic Acids Res
; 42(Web Server issue): W264-70, 2014 Jul.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-24728994
20.
NRG-CING: integrated validation reports of remediated experimental biomolecular NMR data and coordinates in wwPDB.
Nucleic Acids Res
; 40(Database issue): D519-24, 2012 Jan.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-22139937