Detalhe da pesquisa
1.
Gene regulatory network inference in the era of single-cell multi-omics.
Nat Rev Genet
; 24(11): 739-754, 2023 Nov.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37365273
2.
Tracking early mammalian organogenesis - prediction and validation of differentiation trajectories at whole organism scale.
Development
; 151(3)2024 Feb 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37982461
3.
Identifying temporal and spatial patterns of variation from multimodal data using MEFISTO.
Nat Methods
; 19(2): 179-186, 2022 02.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35027765
4.
Multi-omics profiling of mouse gastrulation at single-cell resolution.
Nature
; 576(7787): 487-491, 2019 12.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31827285
5.
Curated single cell multimodal landmark datasets for R/Bioconductor.
PLoS Comput Biol
; 19(8): e1011324, 2023 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37624866
6.
Multi-Omics Factor Analysis-a framework for unsupervised integration of multi-omics data sets.
Mol Syst Biol
; 14(6): e8124, 2018 06 20.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29925568
7.
8C-like cells capture the human zygotic genome activation program in vitro.
Cell Stem Cell
; 29(3): 449-459.e6, 2022 03 03.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35216671
8.
Single-cell multi-omics profiling links dynamic DNA methylation to cell fate decisions during mouse early organogenesis.
Genome Biol
; 23(1): 202, 2022 09 26.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36163261
9.
Computational principles and challenges in single-cell data integration.
Nat Biotechnol
; 39(10): 1202-1215, 2021 10.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33941931
10.
scMET: Bayesian modeling of DNA methylation heterogeneity at single-cell resolution.
Genome Biol
; 22(1): 114, 2021 04 20.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33879195
11.
Integrative Transkingdom Analysis of the Gut Microbiome in Antibiotic Perturbation and Critical Illness.
mSystems
; 6(2)2021 Mar 16.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33727397
12.
MOFA+: a statistical framework for comprehensive integration of multi-modal single-cell data.
Genome Biol
; 21(1): 111, 2020 05 11.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32393329
13.
scNMT-seq enables joint profiling of chromatin accessibility DNA methylation and transcription in single cells.
Nat Commun
; 9(1): 781, 2018 02 22.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29472610
14.
Author Correction: Community-wide hackathons to identify central themes in single-cell multi-omics.
Genome Biol
; 22(1): 246, 2021 Aug 25.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34433496
15.
Community-wide hackathons to identify central themes in single-cell multi-omics.
Genome Biol
; 22(1): 220, 2021 08 05.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34353350