Detalhe da pesquisa
1.
Searching COVID-19 Clinical Research Using Graph Queries: Algorithm Development and Validation.
J Med Internet Res
; 26: e52655, 2024 May 30.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38814687
2.
The road towards data integration in human genomics: players, steps and interactions.
Brief Bioinform
; 22(1): 30-44, 2021 01 18.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32496509
3.
A review on viral data sources and search systems for perspective mitigation of COVID-19.
Brief Bioinform
; 22(2): 664-675, 2021 03 22.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33348368
4.
Federated sharing and processing of genomic datasets for tertiary data analysis.
Brief Bioinform
; 22(3)2021 05 20.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34020536
5.
ViruClust: direct comparison of SARS-CoV-2 genomes and genetic variants in space and time.
Bioinformatics
; 38(7): 1988-1994, 2022 03 28.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35040923
6.
ViruSurf: an integrated database to investigate viral sequences.
Nucleic Acids Res
; 49(D1): D817-D824, 2021 01 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33045721
7.
VirusViz: comparative analysis and effective visualization of viral nucleotide and amino acid variants.
Nucleic Acids Res
; 49(15): e90, 2021 09 07.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34107016
8.
Identifying collateral and synthetic lethal vulnerabilities within the DNA-damage response.
BMC Bioinformatics
; 22(1): 250, 2021 May 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33992077
9.
Exploring chromatin conformation and gene co-expression through graph embedding.
Bioinformatics
; 36(Suppl_2): i700-i708, 2020 12 30.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33381846
10.
Search and comparison of (epi)genomic feature patterns in multiple genome browser tracks.
BMC Bioinformatics
; 21(1): 464, 2020 Oct 19.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33076821
11.
Processing of big heterogeneous genomic datasets for tertiary analysis of Next Generation Sequencing data.
Bioinformatics
; 35(5): 729-736, 2019 03 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30101316
12.
PyGMQL: scalable data extraction and analysis for heterogeneous genomic datasets.
BMC Bioinformatics
; 20(1): 560, 2019 Nov 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31703553
13.
Explorative visual analytics on interval-based genomic data and their metadata.
BMC Bioinformatics
; 18(1): 536, 2017 Dec 04.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29202689
14.
TCGA2BED: extracting, extending, integrating, and querying The Cancer Genome Atlas.
BMC Bioinformatics
; 18(1): 6, 2017 Jan 03.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28049410
15.
Modeling and interoperability of heterogeneous genomic big data for integrative processing and querying.
Methods
; 111: 3-11, 2016 12 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-27637471
16.
GenoMetric Query Language: a novel approach to large-scale genomic data management.
Bioinformatics
; 31(12): 1881-8, 2015 Jun 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-25649616
17.
Explorative search of distributed bio-data to answer complex biomedical questions.
BMC Bioinformatics
; 15 Suppl 1: S3, 2014.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-24564278
18.
Integrated Bio-Search: challenges and trends for the integration, search and comprehensive processing of biological information.
BMC Bioinformatics
; 15 Suppl 1: S2, 2014.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-24564249
19.
Data-driven recombination detection in viral genomes.
Nat Commun
; 15(1): 3313, 2024 Apr 17.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38632281
20.
Social and economic variables explain COVID-19 diffusion in European regions.
Sci Rep
; 14(1): 6142, 2024 03 13.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38480771