Inosine triphosphatase allele frequency and association with ribavirin-induced anaemia in Brazilian patients receiving antiviral therapy for chronic hepatitis C.

Inosine triphosphatase (ITPA) single nucleotide polymorphisms (SNPs) are strongly associated with protection against ribavirin (RBV)-induced anaemia in European, American and Asian patients; however, there is a paucity of data for Brazilian patients. The aim of this study was to evaluate the ITPA SNP (rs7270101/rs1127354) frequency in healthy and hepatitis C virus (HCV)-infected patients from Brazil and the association with the development of severe anaemia during antiviral therapy. ITPA SNPs were determined in 200 HCV infected patients and 100 healthy individuals by sequencing. Biochemical parameters and haemoglobin (Hb) levels were analysed in 97 patients who underwent antiviral therapy. A combination of AArs7270101+CCrs1127354 (100% ITPase activity) was observed in 236/300 individuals. Anaemia was observed in 87.5% and 86.2% of treated patients with AA (rs7270101) and CC genotypes (rs1127354), respectively. Men with AA (rs7270101) showed a considerable reduction in Hb at week 12 compared to those with AC/CC (p = 0.1475). In women, there was no influence of genotype (p = 0.5295). For rs1127354, men with the CC genotype also showed a sudden reduction in Hb compared to those with AC. Allelic distribution of rs7270101 and rs1127354 shows high rates of the genotypes AA and CC, respectively, suggesting that the study population had a great propensity for developing RBV-induced anaemia. A progressive Hb reduction during treatment was observed; however, this reduction was greater in men at week 12 than in women.

SARS-CoV-2 and dialysis: humoral response, clinical and laboratory impacts before vaccination.

BACKGROUND: Patients with kidney disease on Hemodialysis (HD) are susceptible to Coronavirus Disease (COVID-19) due to multiple risk factors. AIM: This study aims to report the prevalence of antibodies against SARS-CoV-2 among patients on hemodialysis before vaccination in Brazil and to compare with clinical, demographic, and laboratory data. METHODS: Blood samples from 398 Chronic Kidney Disease (CKD) patients treated in three different private institutions in Rio de Janeiro State, Brazil were submitted to the total anti-SARS-CoV-2 testing. Kidney, liver, and hematological markers were also determined. Respiratory samples were tested by real-time PCR for SARS-CoV-2 RNA and positive samples were subjected to high-throughput sequencing on the MinION device. RESULTS: Overall, anti-SARS-CoV-2 prevalence was 54.5 % (217/398) and two individuals had SARS-CoV-2 RNA with variant B.1.1. High anti-SARS-CoV-2 seroprevalence was found in male gender and those with hospital admission in the last 3-months before the inclusion in the study. Lower red blood cell count was observed in the anti-SARS-CoV-2 seropositive group. High levels of anti-SARS-CoV-2 were found in those who reported symptoms, had low levels of eosinophils and low hematocrit, and who practiced physical activity. CONCLUSION: High prevalence of anti-SARS-CoV-2 was found in CKD patients before the universal immunization in Brazil suggesting that dialysis patients were highly exposed to SARS-CoV-2.

SARS-CoV-2 and dialysis: humoral response, clinical and laboratory impacts before vaccination

Abstract Background Patients with kidney disease on Hemodialysis (HD) are susceptible to Coronavirus Disease (COVID-19) due to multiple risk factors. Aim This study aims to report the prevalence of antibodies against SARS-CoV-2 among patients on hemodialysis before vaccination in Brazil and to compare with clinical, demographic, and laboratory data. Methods Blood samples from 398 Chronic Kidney Disease (CKD) patients treated in three different private institutions in Rio de Janeiro State, Brazil were submitted to the total anti-SARS-CoV-2 testing. Kidney, liver, and hematological markers were also determined. Respiratory samples were tested by real-time PCR for SARS-CoV-2 RNA and positive samples were subjected to high-throughput sequencing on the MinION device. Results Overall, anti-SARS-CoV-2 prevalence was 54.5 % (217/398) and two individuals had SARS-CoV-2 RNA with variant B.1.1. High anti-SARS-CoV-2 seroprevalence was found in male gender and those with hospital admission in the last 3-months before the inclusion in the study. Lower red blood cell count was observed in the anti-SARS-CoV-2 seropositive group. High levels of anti-SARS-CoV-2 were found in those who reported symptoms, had low levels of eosinophils and low hematocrit, and who practiced physical activity. Conclusion High prevalence of anti-SARS-CoV-2 was found in CKD patients before the universal immunization in Brazil suggesting that dialysis patients were highly exposed to SARS-CoV-2.

Impacto de mutações de resistência no vírus da hepatite C na resposta ao tratamento com os novos antivirais de ação direta

O tratamento da hepatite C tem evoluído de forma considerável ao longo dos anos a partir do desenvolvimento de moléculas denominadas antivirais de ação direta (DAAs) que inibem proteínas não estruturais do vírus da hepatite C (HCV), como por exemplo, simeprevir (SMV), daclatasvir (DCV) e sofosbuvir (SOF), inibidores das proteínas NS3, NS5A e NS5B do HCV, respectivamente. O licenciamento de esquemas terapêuticos com DAAs permitiu um aumento das taxas de resposta virológica sustentada (RVS), porém a seleção de estirpes virais com substituições associadas à resistência (RASs) aos antivirais pode ser considerada um dos fatores determinantes para a ocorrência de falha terapêutica. A presente tese teve como objetivo avaliar a frequência de resistência basal através da identificação de RASs nas proteínas NS3, NS5A e NS5B do HCV e analisar seu possível impacto clínico no tratamento antiviral com DAAs para diferentes grupos de indivíduos com hepatite C crônica: monoinfectados pelos genótipos 1 e 3 do HCV e coinfectados HCV/HIV, tendo em ambos os grupos pacientes experimentados por terapias prévias com DAAs e virgens de tratamento. Como principais resultados obtidos nos três manuscritos produzidos, destacamos (i) a prevalência de RASs na proteína NS3 do HCV em pacientes previamente experimentados que falharam a terapia com os IPs telaprevir/boceprevir foi maior em comparação com a dos pacientes não experimentados, provavelmente devido à pressão seletiva imposta pela droga; (ii) as RASs V36M e R155K podem reduzir a susceptibilidade a IPs aprovados no Brasil, tais como o SMV, paritaprevir e grazoprevir, sendo que a mutação no resíduo 36 foi a mais prevalente nas sequências de aminoácidos da proteína NS3 para o genótipo 1a do HCV; (iii) considerando a baixa prevalência da RAS Q80K nas estirpes do HCV circulantes no Brasil, não há necessidade de testes de resistência no pré-tratamento com SMV; (iv) as altas taxas de RVS de portadores crônicos brasileiros na prática de rotina clínica foram semelhantes a dos ensaios clínicos controlados para a terapia combinada com o uso de SOF e DCV (acima de 95%); (v) a ocorrência e persistência das RASs específicas nas posições 30 e 93 da proteína NS5A do HCV pode ter influenciado na não resposta de dois pacientes com hepatite C crônica submetidos ao tratamento com SOF e DCV. Em conclusão, nossos achados sugeriram que a ocorrência de mutações basais nas proteínas NS3, NS5A e NS5B do HCV não seria um fator limitante para o sucesso terapêutico com os DAAs aprovados em protocolos clínicos brasileiros. Entretanto, a combinação de fatores de prognóstico negativo para o alcance da RVS em alguns casos clínicos particulares justifica a realização de testes moleculares de resistência no sentido de definir uma melhor terapia de resgate.

Inosine triphosphatase allele frequency and association with ribavirin-induced anaemia in Brazilian patients receiving antiviral therapy for chronic hepatitis C

Inosine triphosphatase (ITPA) single nucleotide polymorphisms (SNPs) are strongly associated with protection against ribavirin (RBV)-induced anaemia in European, American and Asian patients; however, there is a paucity of data for Brazilian patients. The aim of this study was to evaluate the ITPA SNP (rs7270101/rs1127354) frequency in healthy and hepatitis C virus (HCV)-infected patients from Brazil and the association with the development of severe anaemia during antiviral therapy. ITPA SNPs were determined in 200 HCV infected patients and 100 healthy individuals by sequencing. Biochemical parameters and haemoglobin (Hb) levels were analysed in 97 patients who underwent antiviral therapy. A combination of AArs7270101+CCrs1127354 (100% ITPase activity) was observed in 236/300 individuals. Anaemia was observed in 87.5% and 86.2% of treated patients with AA (rs7270101) and CC genotypes (rs1127354), respectively. Men with AA (rs7270101) showed a considerable reduction in Hb at week 12 compared to those with AC/CC (p = 0.1475). In women, there was no influence of genotype (p = 0.5295). For rs1127354, men with the CC genotype also showed a sudden reduction in Hb compared to those with AC. Allelic distribution of rs7270101 and rs1127354 shows high rates of the genotypes AA and CC, respectively, suggesting that the study population had a great propensity for developing RBV-induced anaemia. A progressive Hb reduction during treatment was observed; however, this reduction was greater in men at week 12 than in women.

Mutações na região NS3 do genoma do vírus da hepatite C associadas à resistência aos inibidores de protease

Um dos fatores limitantes da eficácia da terapia antiviral no tratamento da infecção pelo vírus da Hepatite C (HCV) com o uso de inibidores de protease (IP) é o surgimento de resistência causada por mutações pontuais. Objetivo: Analisar a prevalência de mutações na região da serino-protease da NS3 associadas à resistência aos IP em pacientes infectados pelos subtipos 1a e 1b do HCV. Métodos: Extração de RNA viral, reação de PCR com primers específicos para cada subtipo e purificação seguida pela reação de sequenciamento nucleotídico foram realizadas. As sequências obtidas abrangendo os nucleotídeos 3466-3961 do genoma do HCV foram editadas no programa MEGA 6.0. As substituições observadas nas posições de aminoácidos associadas à resistência aos IP foram relacionadas após submissão ao site geno2pheno. Resultados: Um total de 65 amostras (Subtipo 1a: n=47; Subtipo 1b: n=18) de pacientes não-respondedores ao tratamento prévio por terapia dupla IFN/RBV (n=8) ou terapia tripla com IP boceprevir ou telaprevir (n=15) e virgens de tratamento (n=42) foram sequenciadas As mutações V36M/L e R155K foram observadas apenas no subtipo 1a, em 33,3% e 4,7% respectivamente, dos pacientes não-respondedores à terapia dupla/tripla. Em pacientes virgens de tratamento, a mutação V36M foi observada em uma (3,8%) sequência do subtipo 1a e a T54S em uma (6,25%) do subtipo 1b. A mutação Q80K associada à resistência ao Simeprevir não foi observada em nenhuma sequência do subtipo 1a neste estudo, porém foi detectada pela primeira vez no Brasil em uma sequência do subtipo 1b de paciente virgem de tratamento. Conclusão: Os dados desse trabalho destacam que os isolados brasileiros do HCV apresentam um padrão distinto de polimorfismos associados à resistência ao simeprevir em comparação a outros países, evidenciando que não há necessidade de incorporação de testes de resistência pré-tratamento para pacientes infectados por subtipos 1a e 1b do HCV

Mutações na região NS3 do genoma do vírus da hepatite C associadas à resistência aos inibidores de protease

Introdução: Um dos fatores limitantes da eficácia da terapia antiviral no tratamento da infecção pelo vírus da Hepatite C (HCV) com o uso de inibidores de protease (IP) é o surgimento de resistência causada por mutações pontuais. Objetivo: Analisar a prevalência de mutações na região da serino-protease da NS3 associadas à resistência aos IP em pacientes infectados pelos subtipos 1a e 1b do HCV. Métodos: Extração de RNA viral, reação de PCR com primers específicos para cada subtipo e purificação seguida pela reação de sequenciamento nucleotídico foram realizadas. As sequências obtidas abrangendo os nucleotídeos 3466-3961 do genoma do HCV foram editadas no programa MEGA 6.0. As substituições observadas nas posições de aminoácidos associadas à resistência aos IP foram relacionadas após submissão ao site geno2pheno. Resultados: Um total de 65 amostras (Subtipo 1a: n=47; Subtipo 1b: n=18) de pacientes não-respondedores ao tratamento prévio por terapia dupla IFN/RBV (n=8) ou terapia tripla com IP boceprevir ou telaprevir (n=15) e virgens de tratamento (n=42) foram sequenciadas...

Introduction: One of the limiting factors of the effectiveness of the antiviral therapy ofhepatitis C virus (HCV) infection with the use of protease inhibitors (PI) is theemergence of resistance due to point mutations. Aim: To analyze the prevalence ofmutations in the HCV NS3 serine protease associated with PI resistance in patientsinfected with subtypes 1a and 1b of HCV. Methods: Viral RNA extraction, PCRreactions with specific primers for each subtype and purification followed bynucleotide sequencing reaction were performed. The obtained sequences coveringnucleotides 3466-3961 of the HCV genome were analyzed by MEGA 6.0 program.The substitutions observed in the amino acid positions associated with PI resistancewere related after submission to the site geno2pheno. Results: A total of 65 samples(subtype 1a: n=47; subtype 1b: n=18) of non-responding patients to previoustreatment by dual therapy IFN/RBV (n=8) or triple therapy with PI boceprevir ortelaprevir (n=15) and treatment-naïve patients (n=42) were sequenced...

Práticas sexuais como fator para o aumento da incidência de hepatites virais em homens que fazem sexo com homens

Inúmeros estudos ao longo dos anos têm descrito que homens que fazem sexo com homens (HSH) estão expostos a infecções sexualmente transmissíveis (ISTs), como as hepatites virais. Recentemente, surtos de Hepatite A (HAV) e o aumento da incidencia da infecção pelo vírus da hepatite C (HCV) entre indivíduos HIV positivos, vêm sendo associados à praticas sexuais como sexo oro-anal e sexo desprotegido. O presente estudo teve como objetivo avaliar dados epidemiológicos, sorológicos e moleculares de dois grupos distintos de pacientes HSH atendidos em um ambulatório de hepatites virais.