Complete genome analysis of Tequatrovirus ufvareg1, a Tequatrovirus species inhibiting Escherichia coli O157:H7.

Introduction: Bacteriophages infecting human pathogens have been considered potential biocontrol agents, and studying their genetic content is essential to their safe use in the food industry. Tequatrovirus ufvareg1 is a bacteriophage named UFV-AREG1, isolated from cowshed wastewater and previously tested for its ability to inhibit Escherichia coli O157:H7. Methods: T. ufvareg1 was previously isolated using E. coli O157:H7 (ATCC 43895) as a bacterial host. The same strain was used for bacteriophage propagation and the one-step growth curve. The genome of the T. ufvareg1 was sequenced using 305 Illumina HiSeq, and the genome comparison was calculated by VIRIDIC and VIPTree. Results: Here, we characterize its genome and compare it to other Tequatrovirus. T. ufvareg1 virions have an icosahedral head (114 x 86 nm) and a contracted tail (117 x 23 nm), with a latent period of 25 min, and an average burst size was 18 phage particles per infected E. coli cell. The genome of the bacteriophage T. ufvareg1 contains 268 coding DNA sequences (CDS) and ten tRNA genes distributed in both negative and positive strains. T. ufvareg1 genome also contains 40 promoters on its regulatory regions and two rho-independent terminators. T. ufvareg1 shares an average intergenomic similarity (VIRIDC) of 88.77% and an average genomic similarity score (VipTree) of 88.91% with eight four reference genomes for Tequatrovirus available in the NCBI RefSeq database. The pan-genomic analysis confirmed the high conservation of Tequatrovirus genomes. Among all CDS annotated in the T. ufvareg1 genome, there are 123 core genes, 38 softcore genes, 94 shell genes, and 13 cloud genes. None of 268 CDS was classified as being exclusive of T. ufvareg1. Conclusion: The results in this paper, combined with other previously published findings, indicate that T. ufvareg1 bacteriophage is a potential candidate for food protection against E. coli O157:H7 in foods.

Hidrogeis de polivinil-álcool (PVA) contendo o bacteriófago UFV-AREG1 para aplicação como curativo adesivo para a indústria de alimentos / Polyvinyl-alcohol (PVA) hydrogel containing the UFV-AREG1 bacteriophagus for application as a curative adhesive for the food industry

Infecções cutâneas obtidas por cortes nas mãos de manipuladores podem gerar contaminação nos alimentos. O objetivo deste trabalho foi incorporar o bacteriófago UFV-AREG1 em hidrogel de álcool poli(vinílico) – PVA, aplicando-o futuramente como curativo adesivo. Foi adicionado 1,0 mL de solução do fago no PVA e seco em estufa por 48 h. Após, os hidrogeis foram submetidos a testes de Intumescimento, Espectroscopia no infravermelho (FTIR) e efeito antimicrobiano sobre E. coli O157:H7. O intumescimento do PVA-fago foi maior que o PVA-controle (p<0,05). A área de inibição do PVA-fago foi de 3,715 cm2 contra 2,916 cm2 do controle. As análises do FTIR mostraram um pico para o PVA-fago não encontrado no PVA-controle. Foi possível incorporar o bacteriófago em hidrogel de PVA e avaliar sua liberação para posterior aplicação como curativo adesivo.

Salmonella sp em suínos alimentados com probiótico e promotores de crescimento / Salmonella sp in probiotic-fed swine and growth promoters

O presente estudo teve como objetivo acompanhar a incidência de Salmonella sp. em fezes e órgãos de suínos alimentados com dietas adicionadas de antibióticos e probióticos. Suínos sadios foram alimentados com ração basal acrescida de avilamicina (T0), ração basal em que 50% foi adicionada de probiótico (T50) e ração basal em que 100% foi adicionada de probiótico (T100). Ao final de 21, 35 e 63 dias, sete animais de cada tratamento foram abatidos e os órgãos coletados para a realização das análises. As amostras de fezes foram coletadas aos 21, 28, 35, 49 e 63 dias de idade. A contagem de Salmonella sp., nas fezes dos animais de 49 e 63 dias foi menor (p< 0,05) nos animais que se alimentaram da dieta T100. No baço, a contagem de Salmonella sp foi a mesma para os diferentes tratamentos. Com 63 dias de idade, todos os órgãos avaliados apresentaram menor contagem de Salmonella sp nos animais alimentados com T100, quando comparado com T0. Conclui-se que no presente estudo ocorreu redução da carga de Salmonella sp excretada nas fezes e encontrada nos órgãos, o que provavelmente resultará em menor contaminação da carcaça e obtenção de um produto de melhor qualidade.

The efficiency of electrocoagulation using aluminum electrodesin treating wastewater from a dairy industry / Eficiência da eletrocoagulação no tratamento de efluente de uma indústria de laticínios usando eletrodos de alumínio

This research deals with the investigation of electrocoagulation (EC) treatment of wastewater from a dairy plant using aluminum electrodes. Electrolysis time, pH, current density and distance between electrodes were considered to assess the removal efficiency of chemical oxygen demand (COD), total solids (TS) and their fractions and turbidity. Samples were collected from the effluent of a dairy plant using a sampling methodology proportional to the flow. The treatments were applied according to design factorial of half fraction with two levels of treatments and 3 repetitions at the central point. The optimization of parameters for treating dairy industry effluent by electrocoagulation using aluminum electrodes showed that electric current application for 21 minutes, an initial sample pH near 5.0 and a current density of 61.6A m^-2 resulted in a significant reduction in COD by 57%; removal of turbidity by 99%, removal of total suspended solids by 92% and volatile suspended solids by 97%; and a final treated effluent pH of approximately 10. Optimum operating condition was used for cost calculations show that operating cost is approximately 3.48R$ m^-3.

Eletrodos de alumínio foram usados para o tratamento de efluente de uma indústria de laticínios por eletrocoagulação. Tempo de eletrólise, pH, densidade de corrente elétrica e distância entre eletrodos foram os parâmetros operacionais usados para avaliar a eficiência de remoção da demanda química de oxigênio (DQO), sólidos totais (ST) e suas frações e turbidez. Amostras foram coletadas usando a metodologia de amostragem composta, proporcional à vazão. Os tratamentos foram aplicados segundo um delineamento fatorial de meia fração com dois níveis e 3 repetições no ponto central. As melhores condições operacionais foram tempo de eletrólise de 21 minutos, pH inicial de aproximadamente 5,0 e densidade de corrente elétrica de 61,6A m^-2, resultando em redução de 57% de DQO, remoção de turbidez de 99%, remoção de sólidos suspensos totais de 92% e sólidos suspensos voláteis de 97%. O pH do efluente tratado foi de aproximadamente 10. Para a condição otimizada, o custo operacional foi de aproximadamente 3, 48 R$ m^-3.

Interference of some organic substances and microorganisms adhered to stainless steel in ATP-bioluminescence measurement

Adhesion of organic substances and microorganisms on stainless steel surface was evaluated. The log RLU measurement was affected at a lower or higher degree, by type or concentration of the organic substances (casein, lipid, sucrose and their combinations) adhered to surface. However, if the samples analyzed were from the food processing surfaces, they would have been considered to be under satisfactory hygienic conditions with log RLU < 2.18 (< 150 RLU). The log RLU measurements of Staphylococcus carnosus-adhered surfaces, combined with or without the organic substances, were higher (p<0.05) than those of the Bacillus subtilis spores-adhered surface, regardless of the concentration. The samples taken from the surfaces adhered with the casein, lipid, sucrose and 2.9x10¹ DMC.cm-2 and 2.9x10² DMC.ml-1 did not have any significant differences (p>0.05) on ATP-bioluminescence measurements. However, the surfaces adhered with 2.9x10³ DMC.cm-2 of B. subtilis spores and organic substances showed an increase in the log RLU measurement compared to surfaces containing only the organic substances.

A adesão de substâncias orgânicas e de microrganismos em cupons de aço inoxidável ASI 304, #4 foi avaliada. A medida de Unidades Relativas de Luz (RLU) foi afetada em menor ou maior nível pelo tipo e concentração das substâncias orgânicas e suas combinações. Entretanto, se as amostras fossem oriundas de superfícies de processamento de alimentos, elas seriam consideradas em boas condições higiênicas pois as medidas de log URL ficaram abaixo de 2,18 log (< 150 URL) com ou sem adição das substâncias orgânicas e independente da concentração estudada, as células vegetativas apresentaram número de log URL para S. carnosus maior (p<0,05) do que para os esporos de B. subtilis. Amostras de superfícies aderidas com caseína, lipídio e sacarose e 2.9x10¹ CDM.cm-2 ou 2.9x10² CDM.ml-1 não apresentaram diferença significativa (p>0.05) na medida de ATP-bioluminescência. Entretanto, superfícies aderidas com 2.9x10³ CDM.cm-2 de esporos de B. subtilis e as substâncias orgânicas mostraram um aumento no log URL comparado com as superfícies contendo somente substâncias orgânicas.

Qualidade microbiológica do ar de ambientes de uma indústria processamento de carnes, avaliada pelas técnicas da sedimentação em placas e impressão em meio sólido / Microbiological quality of the environment air of an meat industry, evaluated for the techniques of the sedimentation in plates and impression in half solid

Avaliou-se a qualidade microbiológica do ar de oito ambientes de processamento de uma indústria de processamento de carnes, usando as técnicas de sedimentação simples e impressão em meio sólido. Além disso, compararam-se estas duas técnicas, usando-se a relação na recomendação da APHA (1992) e 3UFC da técnica de impressão em meio sólido, para 1 UFC da técnica de sedimentação simples. Verificou-se que somente 12,5 por cento encontravam-se dentro das recomendações para mesófilos aeróbios e 33,3 por cento para fungos filamentosos e leveduras para técnica da sedimentação simples. Já pela técnica de impressão em meio sólido 33 por cento dos ambientes não atenderam as recomendações para a contagem de mesófilos aeróbios e 12,5 por cento para fungos filamentosos e leveduras. Constatou-se, de uma maneira geral que a técnica de impressão em meio sólido recuperou do ar um maior número de fungos filamentosos e leveduras, na maioria dos ambientes analisados. No entanto, na contagem de microrganismos mesófilos aeróbios essa tendência de maior recuperação de microrganismos pela técnica de impressão em meio sólido não foi confirmada. Os resultados sugerem que as informações fornecidas pelas duas técnicas devem ser usadas com cuidado e bom senso.

Efeito da fermentação sobre a microbiota de embutidos cárneos / Effect of the fermentation about the microbiota in meat

Fermentação é importante no processamento de embutidos, etapa na qual ocorrem as principais transformações físicas, bioquímicas e microbiológicas.Os principais objetivos da fermentação, em produtos cárneos, são a formação de sabor característico, desenvolvimento de um produto firme e características de fatiabilidade, além da inibição de bactérias deterioradoras e patogênicas.Produtos cárneos fermentados como os embutidos fermentados secos, não são submetidos a tratamento térmico. Desse modo, a segurança microbiológica e preservação desses produtos são dependentes da associação de vários fatores, incluindo baixa atividade de água, presença de cloreto de sódio e nitrito de sódio, baixo pH e presença de substâncias antimicrobianas adicionadas ou formadas durante o processamento. O processo de fermentação natural para embutidos fermentados envolve a presença de microrganismos ácido-láticos como microbiota natural da carne, sendo os principais representantes as espécies de Lactobacillus, Pediococcus e Micrococcus, com o objetivo de diminuir o tempo do processo fermentativo, uniformizar os produtos entre as bateladas, minimizar perdas e aumentar o sabor e a segurança dos produtos, a indústria de carnes tem optado pelo uso de culturas starters na fabricação de embutidos fermentados. As principais transformações ocorrem na fase de fermentação podem ser resumidas em: mudanças na microflora inicial, redução de pH, redução de nitrato a nitritose este em óxido nítrico, formação de nitrosomioglobina, solubilização e gelificação de proteínas, fenômenos de oxidação e desidratação, inibindo o crescimento de microrganismos indesejáveis e melhorando a qualidade do produto final para a maior conservação e segurança do produto.