Detalhe da pesquisa
1.
De novo design of luciferases using deep learning.
Nature
; 614(7949): 774-780, 2023 02.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36813896
2.
De novo protein design by deep network hallucination.
Nature
; 600(7889): 547-552, 2021 12.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34853475
3.
Atomistic simulation of protein evolution reveals sequence covariation and time-dependent fluctuations of site-specific substitution rates.
PLoS Comput Biol
; 19(3): e1010262, 2023 03.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36961827
4.
Protein sequence design by conformational landscape optimization.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 118(11)2021 03 16.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33712545
5.
An enumerative algorithm for de novo design of proteins with diverse pocket structures.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 117(36): 22135-22145, 2020 09 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32839327
6.
Principles for computational design of binding antibodies.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 114(41): 10900-10905, 2017 10 10.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28973872
7.
High-accuracy modeling of antibody structures by a search for minimum-energy recombination of backbone fragments.
Proteins
; 85(1): 30-38, 2017 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-27717001
8.
AbDesign: An algorithm for combinatorial backbone design guided by natural conformations and sequences.
Proteins
; 83(8): 1385-406, 2015 Aug.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-25670500
9.
Molecular characterization of oxysterol binding to the Epstein-Barr virus-induced gene 2 (GPR183).
J Biol Chem
; 287(42): 35470-35483, 2012 Oct 12.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-22875855
10.
Top-down design of protein architectures with reinforcement learning.
Science
; 380(6642): 266-273, 2023 04 21.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37079676
11.
Small-molecule binding and sensing with a designed protein family.
bioRxiv
; 2023 Nov 02.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37961294
12.
Computational design of sequence-specific DNA-binding proteins.
bioRxiv
; 2023 Sep 21.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37790440
13.
De novo design of diverse small molecule binders and sensors using Shape Complementary Pseudocycles.
bioRxiv
; 2023 Dec 21.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38187589
14.
A thermodynamic model of protein structure evolution explains empirical amino acid substitution matrices.
Protein Sci
; 30(10): 2057-2068, 2021 10.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34218472
15.
A combined computational-experimental approach to define the structural origin of antibody recognition of sialyl-Tn, a tumor-associated carbohydrate antigen.
Sci Rep
; 8(1): 10786, 2018 Jul 17.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30018351
16.
Computational design of protein self-assembly.
Curr Opin Struct Biol
; 39: 39-45, 2016 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-27127996
17.
Mapping the Ca(2+) induced structural change in calreticulin.
J Proteomics
; 142: 138-48, 2016 06 16.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-27195812
18.
Mutation-Guided Unbiased Modeling of the Fat Sensor GPR119 for High-Yield Agonist Screening.
Structure
; 23(12): 2377-2386, 2015 Dec 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-26526849
19.
Assessment and challenges of ligand docking into comparative models of G-protein coupled receptors.
PLoS One
; 8(7): e67302, 2013.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-23844000